Protein–RNA interactions for Protein: D3YUP5

Exoc3l2, Exocyst complex component 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exoc3l2D3YUP5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Exoc3l2D3YUP5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,21
Exoc3l2D3YUP5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Exoc3l2D3YUP5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Exoc3l2D3YUP5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
Exoc3l2D3YUP5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Exoc3l2D3YUP5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,62■■■□□ 2,97
Exoc3l2D3YUP5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Exoc3l2D3YUP5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Exoc3l2D3YUP5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Exoc3l2D3YUP5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Exoc3l2D3YUP5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Exoc3l2D3YUP5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Exoc3l2D3YUP5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Exoc3l2D3YUP5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Exoc3l2D3YUP5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Exoc3l2D3YUP5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Exoc3l2D3YUP5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Exoc3l2D3YUP5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Exoc3l2D3YUP5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Exoc3l2D3YUP5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Exoc3l2D3YUP5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Exoc3l2D3YUP5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Exoc3l2D3YUP5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Exoc3l2D3YUP5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Exoc3l2D3YUP5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Exoc3l2D3YUP5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Exoc3l2D3YUP5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Exoc3l2D3YUP5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Exoc3l2D3YUP5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Exoc3l2D3YUP5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Exoc3l2D3YUP5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Exoc3l2D3YUP5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Exoc3l2D3YUP5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Exoc3l2D3YUP5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Exoc3l2D3YUP5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Exoc3l2D3YUP5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Exoc3l2D3YUP5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Exoc3l2D3YUP5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Exoc3l2D3YUP5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Exoc3l2D3YUP5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Exoc3l2D3YUP5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Exoc3l2D3YUP5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Exoc3l2D3YUP5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Exoc3l2D3YUP5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Exoc3l2D3YUP5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Exoc3l2D3YUP5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Exoc3l2D3YUP5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Exoc3l2D3YUP5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Exoc3l2D3YUP5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Exoc3l2D3YUP5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Exoc3l2D3YUP5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Exoc3l2D3YUP5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Exoc3l2D3YUP5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Exoc3l2D3YUP5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Exoc3l2D3YUP5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Exoc3l2D3YUP5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Exoc3l2D3YUP5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Exoc3l2D3YUP5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Exoc3l2D3YUP5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Exoc3l2D3YUP5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Exoc3l2D3YUP5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Exoc3l2D3YUP5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Exoc3l2D3YUP5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Exoc3l2D3YUP5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Exoc3l2D3YUP5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Exoc3l2D3YUP5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Exoc3l2D3YUP5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Exoc3l2D3YUP5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Exoc3l2D3YUP5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Exoc3l2D3YUP5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Exoc3l2D3YUP5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Exoc3l2D3YUP5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Exoc3l2D3YUP5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Exoc3l2D3YUP5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Exoc3l2D3YUP5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Exoc3l2D3YUP5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Exoc3l2D3YUP5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Exoc3l2D3YUP5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Exoc3l2D3YUP5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Exoc3l2D3YUP5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Exoc3l2D3YUP5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Exoc3l2D3YUP5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Exoc3l2D3YUP5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Exoc3l2D3YUP5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Exoc3l2D3YUP5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Exoc3l2D3YUP5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Exoc3l2D3YUP5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Exoc3l2D3YUP5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Exoc3l2D3YUP5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Exoc3l2D3YUP5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Exoc3l2D3YUP5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Exoc3l2D3YUP5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Exoc3l2D3YUP5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Exoc3l2D3YUP5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Exoc3l2D3YUP5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Exoc3l2D3YUP5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Exoc3l2D3YUP5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Exoc3l2D3YUP5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Exoc3l2D3YUP5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,8 ms