Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Ube3aO08759 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,18■■■■□ 3,54
Ube3aO08759 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Ube3aO08759 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Ube3aO08759 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,98■■■■□ 3,19
Ube3aO08759 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Ube3aO08759 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ube3aO08759 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Ube3aO08759 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ube3aO08759 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Ube3aO08759 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Ube3aO08759 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Ube3aO08759 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Ube3aO08759 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Ube3aO08759 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Ube3aO08759 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,38■■■□□ 2,93
Ube3aO08759 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Ube3aO08759 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,85
Ube3aO08759 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Ube3aO08759 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
Ube3aO08759 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Ube3aO08759 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Ube3aO08759 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Ube3aO08759 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Ube3aO08759 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Ube3aO08759 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Ube3aO08759 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Ube3aO08759 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Ube3aO08759 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Ube3aO08759 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Ube3aO08759 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Ube3aO08759 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Ube3aO08759 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Ube3aO08759 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,07■■■□□ 2,73
Ube3aO08759 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Ube3aO08759 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,7
Ube3aO08759 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Ube3aO08759 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Ube3aO08759 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Ube3aO08759 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Ube3aO08759 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Ube3aO08759 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Ube3aO08759 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ube3aO08759 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Ube3aO08759 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Ube3aO08759 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Ube3aO08759 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Ube3aO08759 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Ube3aO08759 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Ube3aO08759 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Ube3aO08759 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Ube3aO08759 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Ube3aO08759 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Ube3aO08759 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Ube3aO08759 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Ube3aO08759 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ube3aO08759 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ube3aO08759 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ube3aO08759 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Ube3aO08759 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ube3aO08759 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Ube3aO08759 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Ube3aO08759 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Ube3aO08759 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ube3aO08759 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Ube3aO08759 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ube3aO08759 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Ube3aO08759 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ube3aO08759 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Ube3aO08759 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Ube3aO08759 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ube3aO08759 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ube3aO08759 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ube3aO08759 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ube3aO08759 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ube3aO08759 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ube3aO08759 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ube3aO08759 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ube3aO08759 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ube3aO08759 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ube3aO08759 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ube3aO08759 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ube3aO08759 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ube3aO08759 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ube3aO08759 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ube3aO08759 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ube3aO08759 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ube3aO08759 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ube3aO08759 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ube3aO08759 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Ube3aO08759 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ube3aO08759 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ube3aO08759 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ube3aO08759 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Ube3aO08759 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ube3aO08759 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ube3aO08759 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ube3aO08759 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ube3aO08759 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ube3aO08759 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
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