Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,32■■■■■ 5,01
Tm4sf1Q64302 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Tm4sf1Q64302 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Tm4sf1Q64302 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,31■■■■■ 4,04
Tm4sf1Q64302 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
Tm4sf1Q64302 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,49■■■■□ 3,91
Tm4sf1Q64302 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Tm4sf1Q64302 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Tm4sf1Q64302 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Tm4sf1Q64302 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Tm4sf1Q64302 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Tm4sf1Q64302 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,59■■■■□ 3,77
Tm4sf1Q64302 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Tm4sf1Q64302 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Tm4sf1Q64302 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Tm4sf1Q64302 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
Tm4sf1Q64302 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Tm4sf1Q64302 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Tm4sf1Q64302 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Tm4sf1Q64302 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Tm4sf1Q64302 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,12■■■■□ 3,53
Tm4sf1Q64302 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Tm4sf1Q64302 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Tm4sf1Q64302 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Tm4sf1Q64302 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Tm4sf1Q64302 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Tm4sf1Q64302 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Tm4sf1Q64302 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Tm4sf1Q64302 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,65■■■■□ 3,46
Tm4sf1Q64302 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Tm4sf1Q64302 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Tm4sf1Q64302 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,51■■■■□ 3,44
Tm4sf1Q64302 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Tm4sf1Q64302 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Tm4sf1Q64302 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Tm4sf1Q64302 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Tm4sf1Q64302 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Tm4sf1Q64302 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Tm4sf1Q64302 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Tm4sf1Q64302 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Tm4sf1Q64302 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Tm4sf1Q64302 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Tm4sf1Q64302 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Tm4sf1Q64302 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Tm4sf1Q64302 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,36■■■■□ 3,25
Tm4sf1Q64302 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Tm4sf1Q64302 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Tm4sf1Q64302 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Tm4sf1Q64302 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Tm4sf1Q64302 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Tm4sf1Q64302 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Tm4sf1Q64302 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Tm4sf1Q64302 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Tm4sf1Q64302 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,8■■■■□ 3,16
Tm4sf1Q64302 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Tm4sf1Q64302 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Tm4sf1Q64302 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Tm4sf1Q64302 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,74■■■■□ 3,15
Tm4sf1Q64302 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Tm4sf1Q64302 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Tm4sf1Q64302 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,51■■■■□ 3,12
Tm4sf1Q64302 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Tm4sf1Q64302 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Tm4sf1Q64302 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Tm4sf1Q64302 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Tm4sf1Q64302 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Tm4sf1Q64302 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Tm4sf1Q64302 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Tm4sf1Q64302 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Tm4sf1Q64302 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Tm4sf1Q64302 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Tm4sf1Q64302 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Tm4sf1Q64302 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Tm4sf1Q64302 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Tm4sf1Q64302 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Tm4sf1Q64302 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Tm4sf1Q64302 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Tm4sf1Q64302 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Tm4sf1Q64302 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Tm4sf1Q64302 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Tm4sf1Q64302 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Tm4sf1Q64302 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Tm4sf1Q64302 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Tm4sf1Q64302 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Tm4sf1Q64302 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Tm4sf1Q64302 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Tm4sf1Q64302 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Tm4sf1Q64302 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Tm4sf1Q64302 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Tm4sf1Q64302 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Tm4sf1Q64302 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Tm4sf1Q64302 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Tm4sf1Q64302 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,81■■■■□ 3
Tm4sf1Q64302 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Tm4sf1Q64302 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
Tm4sf1Q64302 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Tm4sf1Q64302 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Tm4sf1Q64302 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Tm4sf1Q64302 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Tm4sf1Q64302 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
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