Protein–RNA interactions for Protein: Q02614

Sap30bp, SAP30-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30bpQ02614 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Sap30bpQ02614 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Sap30bpQ02614 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Sap30bpQ02614 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Sap30bpQ02614 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Sap30bpQ02614 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Sap30bpQ02614 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Sap30bpQ02614 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sap30bpQ02614 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Sap30bpQ02614 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Sap30bpQ02614 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sap30bpQ02614 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Sap30bpQ02614 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Sap30bpQ02614 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Sap30bpQ02614 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sap30bpQ02614 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Sap30bpQ02614 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Sap30bpQ02614 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Sap30bpQ02614 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sap30bpQ02614 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sap30bpQ02614 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Sap30bpQ02614 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sap30bpQ02614 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Sap30bpQ02614 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sap30bpQ02614 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sap30bpQ02614 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sap30bpQ02614 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sap30bpQ02614 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Sap30bpQ02614 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Sap30bpQ02614 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sap30bpQ02614 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sap30bpQ02614 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Sap30bpQ02614 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sap30bpQ02614 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Sap30bpQ02614 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Sap30bpQ02614 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sap30bpQ02614 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sap30bpQ02614 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sap30bpQ02614 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sap30bpQ02614 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sap30bpQ02614 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sap30bpQ02614 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sap30bpQ02614 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sap30bpQ02614 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sap30bpQ02614 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sap30bpQ02614 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sap30bpQ02614 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sap30bpQ02614 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sap30bpQ02614 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Sap30bpQ02614 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sap30bpQ02614 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sap30bpQ02614 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sap30bpQ02614 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sap30bpQ02614 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sap30bpQ02614 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sap30bpQ02614 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sap30bpQ02614 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sap30bpQ02614 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sap30bpQ02614 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sap30bpQ02614 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sap30bpQ02614 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sap30bpQ02614 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Sap30bpQ02614 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sap30bpQ02614 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Sap30bpQ02614 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sap30bpQ02614 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sap30bpQ02614 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sap30bpQ02614 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Sap30bpQ02614 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sap30bpQ02614 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sap30bpQ02614 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sap30bpQ02614 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sap30bpQ02614 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sap30bpQ02614 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sap30bpQ02614 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sap30bpQ02614 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sap30bpQ02614 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sap30bpQ02614 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sap30bpQ02614 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sap30bpQ02614 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sap30bpQ02614 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sap30bpQ02614 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sap30bpQ02614 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.89■■■□□ 2.85
Sap30bpQ02614 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Sap30bpQ02614 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sap30bpQ02614 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sap30bpQ02614 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sap30bpQ02614 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sap30bpQ02614 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Sap30bpQ02614 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sap30bpQ02614 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sap30bpQ02614 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sap30bpQ02614 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sap30bpQ02614 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sap30bpQ02614 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sap30bpQ02614 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sap30bpQ02614 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Sap30bpQ02614 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Sap30bpQ02614 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sap30bpQ02614 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 376.6 ms