Protein–RNA interactions for Protein: O35295

Purb, Transcriptional activator protein Pur-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PurbO35295 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PurbO35295 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PurbO35295 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PurbO35295 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PurbO35295 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PurbO35295 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PurbO35295 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PurbO35295 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PurbO35295 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PurbO35295 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PurbO35295 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PurbO35295 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PurbO35295 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PurbO35295 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PurbO35295 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PurbO35295 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PurbO35295 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PurbO35295 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PurbO35295 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PurbO35295 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PurbO35295 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PurbO35295 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PurbO35295 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PurbO35295 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PurbO35295 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PurbO35295 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PurbO35295 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PurbO35295 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PurbO35295 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PurbO35295 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PurbO35295 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PurbO35295 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PurbO35295 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PurbO35295 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PurbO35295 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PurbO35295 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PurbO35295 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PurbO35295 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PurbO35295 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PurbO35295 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PurbO35295 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PurbO35295 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PurbO35295 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PurbO35295 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PurbO35295 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PurbO35295 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PurbO35295 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PurbO35295 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PurbO35295 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PurbO35295 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PurbO35295 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PurbO35295 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PurbO35295 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PurbO35295 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PurbO35295 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PurbO35295 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PurbO35295 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PurbO35295 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PurbO35295 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PurbO35295 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PurbO35295 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PurbO35295 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PurbO35295 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PurbO35295 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PurbO35295 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PurbO35295 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PurbO35295 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PurbO35295 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PurbO35295 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PurbO35295 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PurbO35295 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PurbO35295 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PurbO35295 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PurbO35295 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PurbO35295 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PurbO35295 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PurbO35295 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PurbO35295 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PurbO35295 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PurbO35295 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PurbO35295 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PurbO35295 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PurbO35295 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PurbO35295 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PurbO35295 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PurbO35295 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PurbO35295 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PurbO35295 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PurbO35295 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PurbO35295 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PurbO35295 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PurbO35295 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PurbO35295 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PurbO35295 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PurbO35295 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PurbO35295 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PurbO35295 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PurbO35295 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PurbO35295 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PurbO35295 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms