RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	YDR124W	Q04608	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RSC3	Q06639	885 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YLR413W	Q06689	675 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SGO1	Q08490	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YOR238W	Q08634	303 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MLH3	Q12083	715 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MHT1	Q12525	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NHA1	Q99271	985 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FRT1	Q99332	602 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YAR066W	P0CX18	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	IDI1	P15496	288 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	KIN3	P22209	435 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	OCA4	P25366	362 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	LIP5	P32875	414 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MRP8	P35719	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	STB6	P36085	766 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SKG1	P36169	355 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GIP1	P38229	639 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MPS3	P47069	682 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NAS6	P50086	228 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	DIA3	P52290	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RMR1	P53060	241 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SPC105	P53148	917 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MPS1	P54199	764 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SDH1	Q00711	640 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PML39	Q03760	334 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RAD33	Q04231	177 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	EMI1	Q04406	187 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	BSC2	Q05611	235 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GGA1	Q06336	557 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	TAF3	Q12297	353 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PSY3	Q12318	242 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	AHC1	Q12433	566 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YOR338W	Q99326	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MSS18	P08593	268 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MRPS28	P21771	286 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RSC6	P25632	483 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YJU3	P28321	313 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PTP2	P29461	750 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ATP11	P32453	318 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	EMC3	P36039	253 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FTH1	P38310	465 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MED6	P38782	295 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	BEM4	P39011	633 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FAA2	P39518	744 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SWD1	P39706	426 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ERV46	P39727	415 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MTW1	P39731	289 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SER33	P40510	469 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MPH1	P40562	993 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
RPL21B	YPL079W	SPO19	Q03029	223 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NSE5	Q03718	556 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	CIA1	Q05583	330 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GMC2	Q06201	188 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	UAF30	Q08747	228 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MUM3	Q08750	479 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ULA1	Q12059	462 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NSL1	Q12143	216 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NTO1	Q12311	748 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	STT4	P37297	1900 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HTA2	P04912	132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	KAR1	P11927	433 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	STE6	P12866	1290 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	ATR1	P13090	542 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	KEX2	P13134	814 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	RAM1	P22007	431 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	ATP7	P30902	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	SYN8	P31377	255 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	PPX1	P38698	397 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	DBP8	P38719	431 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	HSE1	P38753	452 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	TDA11	P38854	504 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL21B	YPL079W	YHR218W	P38899	603 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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