RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W PEX8P53248 589 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RTC4P53850 401 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SND1Q04007 877 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W DON1Q05610 365 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W MCP2Q06567 569 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PEX15Q08215 383 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.23□□□□□ -2.05not detected
SSQ1YLR369W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NBL1Q3E7Y6 73 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CDC26P14724 124 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HOP1P20050 605 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SWI3P32591 825 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PXA2P34230 853 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W EMP65P40085 556 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RSM25P40496 264 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W VHS1Q03785 461 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TCO89Q08921 799 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YPL272CQ08984 517 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W VPS54Q12071 889 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SLX4Q12098 748 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PMA2P19657 947 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W GEX1P25596 615 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SEF1P34228 1148 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YKL050CP35736 922 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HOT13P36078 116 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W GEX2P36173 615 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PIM1P36775 1133 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TAE1P38340 232 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ELO1P39540 310 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PRM2P40534 656 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CFD1P40558 293 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W BIR1P47134 954 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CTF18P49956 741 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NBP35P52920 328 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YGL260WP53056 76 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W EMC4P53073 190 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HOL1P53389 586 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TIM8P57744 87 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PIR1Q03178 341 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TRS23Q03784 219 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PPM1Q04081 328 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YMR018WQ04364 514 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SIL1Q08199 421 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YLR046CQ12253 270 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W GLE1Q12315 538 aa2.22□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SUC2P00724 532 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ERG11P10614 530 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W MTC7P32633 139 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CDS1P38221 457 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TMN3P40071 706 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SPG5P42933 373 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W MNT2P53059 558 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YIP4P53093 235 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W COG7P53195 279 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RSC1P53236 928 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W AIM32Q04689 311 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YDL073WQ07454 984 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YAP7Q08182 245 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TMS1Q12116 473 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.21□□□□□ -2.05not detected
SSQ1YLR369W SEC39Q12745 709 aa2.21□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W TUP1P16649 713 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W LDB16P25587 256 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W CNE1P27825 502 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W NOP4P37838 685 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W MUM2P38236 366 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W CTM1P38818 585 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W BST1P43571 1029 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W ATG36P46983 293 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W TAX4P47030 604 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W RTT101P47050 842 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W CPR7P47103 393 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W YJR079WP47126 109 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W GLO1P50107 326 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W PRM1P53835 661 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W YNL092WP53934 400 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W ATG10Q07879 167 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W YLR012CQ07927 99 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W MLH2Q07980 695 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W YOL024WQ08172 172 aa2.21□□□□□ -2.06
SSQ1YLR369W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
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