RNA–Protein interactions for RNA: YLR356W

ATG33, Transcript of Mitochondrial mitophagy-specific protein, yeast

Gene ATG33, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG33	YLR356W	END3	P39013	349 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	RGA1	P39083	1007 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	BTN2	P53286	410 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	GIC2	Q06648	383 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	IMA2	Q08295	589 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	HOS1	Q12214	470 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	CMP2	P14747	604 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	MET8	P15807	274 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	ARG1	P22768	420 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	RAD57	P25301	460 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YCR102C	P25608	368 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YCR099C	P25657	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	ATP11	P32453	318 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	MKK1	P32490	508 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	MNL1	P38888	796 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	VRG4	P40107	337 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	PXA1	P41909	870 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	IBA57	P47158	497 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	SPP2	Q02521	185 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	TPP1	Q03796	238 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	HED1	Q03937	162 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	NHX1	Q04121	633 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	SOV1	Q04748	898 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	RSC3	Q06639	885 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	LDB17	Q12342	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	QCR6	P00127	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	PMT2	P31382	759 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	SKT5	P34226	696 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	PCH2	P38126	564 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	RPS27B	P38711	82 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	TCD1	P38756	429 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	SMF2	P38778	549 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	MBP1	P39678	833 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	NNF1	P47149	201 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	MPS2	P53159	387 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	TFB3	Q03290	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	BDS1	Q08347	646 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	UPC2	Q12151	913 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG33	YLR356W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
ATG33	YLR356W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MXR2	P25566	168 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CNS1	P33313	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TOM20	P35180	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CAB3	P36076	571 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	GGC1	P38988	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	DSS1	P39112	969 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ATG36	P46983	293 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YPS7	Q06325	596 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TPO4	Q12256	659 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	PST1	Q12355	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	AGP1	P25376	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ADE1	P27616	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MRPL10	P36520	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	EHT1	P38295	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MNN1	P39106	762 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SCC4	P40090	624 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YMR134W	P40207	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	EFM4	P40516	257 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CUP9	P41817	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	STB2	P46679	850 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MPS1	P54199	764 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ROY1	Q04847	553 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NUS1	Q12063	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	WTM2	Q12206	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NSI1	Q12457	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	AI3	P03877	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	PHO2	P07269	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CDC4	P07834	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	PEP5	P12868	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms