RNA–Protein interactions for RNA: YHL048W

COS8, Transcript of Nuclear membrane protein, yeast

Gene COS8, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COS8	YHL048W	CST26	P38226	397 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	GPI8	P49018	411 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	CRN1	Q06440	651 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	FMP45	Q07651	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	ATG29	Q12092	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	EDE1	P34216	1381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
COS8	YHL048W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	VMA16	P23968	213 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	CCT6	P39079	546 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	CTK2	P46962	323 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	UBX6	P47049	396 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	YAT1	P80235	687 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	VPS38	Q05919	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	NFI1	Q12216	726 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	AFI1	Q99222	893 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	STF1	P01098	86 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	GAL80	P04387	435 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	TFB1	P32776	642 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	MNN2	P38069	597 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	MTG2	P38860	518 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	MEP1	P40260	492 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	IRC8	P47046	822 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	PET130	P47065	347 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	VID30	P53076	958 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	ROY1	Q04847	553 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	CYK3	Q07533	885 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COS8	YHL048W	COX1	P00401	534 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	MGM1	P32266	881 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	GDA1	P32621	518 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	SEF1	P34228	1148 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	BUR6	P40096	142 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	SWP82	P43554	623 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	NPA3	P47122	385 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	SCS3	P53012	380 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	UBP16	Q02863	499 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	RAD33	Q04231	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	RSF1	Q05043	376 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	SWA2	Q06677	668 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	CRT10	Q08226	957 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	CRC1	Q12289	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	GPM3	Q12326	303 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	FRE6	Q12473	712 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	AVL9	Q12500	764 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	ERV1	P27882	189 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	PUP2	P32379	260 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	PMT1	P33775	817 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	ERC1	P38767	581 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	EFM4	P40516	257 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
COS8	YHL048W	TCB2	P48231	1178 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	CUL3	P53202	744 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	IPI3	P53877	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	INA17	Q02888	182 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YML053C	Q04978	212 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	ISN1	Q99312	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	SNF2	P22082	1703 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	AMD2	P22580	549 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	MAK32	P23060	363 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COS8	YHL048W	YSP3	P25036	478 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms