RNA–Protein interactions for RNA: YGL011C

SCL1, Transcript of Alpha 1 subunit of the 20S proteasome, yeast

Gene SCL1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCL1	YGL011C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	FOB1	O13329	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	YCR043C	P25361	127 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	JNM1	P36224	373 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	MET18	P40469	1032 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	SNG1	P46950	547 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	SRB7	P47822	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	YGR126W	P53274	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	MPS1	P54199	764 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	SMA1	Q02651	245 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
SCL1	YGL011C	ICT1	Q12385	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCL1	YGL011C	ROX1	P25042	368 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PRD1	P25375	712 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	GPI10	P30777	616 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PHD1	P36093	366 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	CST26	P38226	397 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	ERG7	P38604	731 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	LAG1	P38703	411 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	AIM22	P47051	409 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	BUD32	P53323	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	DIC1	Q06143	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	RED1	P14291	827 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SNC1	P31109	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YME1	P32795	747 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	MSR1	P38714	643 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	FIN1	Q03898	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	RSF1	Q05043	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SSK1	Q07084	712 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YAP7	Q08182	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	MRE11	P32829	692 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YIL169C	P40442	995 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	JJJ1	P53863	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SEC5	P89102	971 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	CDC45	Q08032	650 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	RIM20	Q12033	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	GRX6	Q12438	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	RTN2	Q12443	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	HNM1	P19807	563 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	ERG3	P32353	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SPC34	P36131	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	MUM2	P38236	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	VID24	P38263	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YHR210C	P38893	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	MET30	P39014	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YER130C	P39959	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	RHO4	Q00246	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	TOF2	Q02208	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SHR3	Q02774	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	ATG29	Q12092	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SMF1	P38925	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	AXL1	P40851	1208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	AZF1	P41696	914 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	MSS11	Q03825	758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	FMP45	Q07651	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	THP1	Q08231	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SRL1	Q08673	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PEP5	P12868	1029 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PMS1	P14242	873 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	TYR1	P20049	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	RAD24	P32641	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PMT1	P33775	817 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YND1	P40009	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	STB2	P46679	850 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	GUF1	P46943	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	TWF1	P53250	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SCM3	Q12334	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCL1	YGL011C	SEC39	Q12745	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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