RNA–Protein interactions for RNA: YER190W

YRF1-2, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-2, Length 5,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2YER190W TIM13P53299 105 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RAD30Q04049 632 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W VID22Q05934 901 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W GUD1Q07729 489 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YPR027CQ12079 277 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W TOP3P13099 656 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YPT52P36018 234 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data8.27□□□□□ -1.09not detected
YRF1-2YER190W SDT1P53078 280 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data8.27□□□□□ -1.09not detected
YRF1-2YER190W AFI1Q99222 893 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MST1P07236 462 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SPE1P08432 466 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W KAR1P11927 433 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W PET127P32606 800 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W LRG1P35688 1017 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RIM2P38127 377 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MIT1P40002 666 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W GCV1P48015 400 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ABZ2Q03266 374 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YMD8Q03697 442 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W BAG7Q12128 409 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MIH1P23748 554 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SET3P36124 751 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W PGM2P37012 569 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W DUN1P39009 513 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W DSS1P39112 969 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ACO2P39533 789 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ERP2P39704 215 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SNF12P53628 566 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W IPI3P53877 555 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YLR036CQ07986 203 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SSA3P09435 649 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YIH1P25637 258 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W PTP2P29461 750 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SKN1P33336 771 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W LOH1P47055 219 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W PUT2P07275 575 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MAS1P10507 462 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W AAT2P23542 418 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W INP51P40559 946 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W PSP1P50896 841 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W IMA1P53051 589 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W FMP45Q07651 309 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YDL199CQ12407 687 aa8.26□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W KIN82P25341 720 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SGE1P33335 543 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YHR218WP38899 603 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W FAD1P38913 306 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W PHB1P40961 287 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ECM7Q06200 448 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W GIS3Q12418 502 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RDI1Q12434 202 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ATP1P07251 545 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SKG1P36169 355 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W COS8P38723 381 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W FCY21P40039 528 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W KTR6P54070 446 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ASA1Q06822 443 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W CYS4P32582 507 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W LDH1P38139 375 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W BIG1P38813 335 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W XDJ1P39102 459 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YER137CP40083 148 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MEP2P41948 499 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MET12P46151 657 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YBR032WP38223 100 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W LNP1P38878 278 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SOK1P40317 901 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W BNA6P43619 295 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SPT20P50875 604 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W CCE1Q03702 353 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YDL121CQ07541 149 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W HAL9Q12180 1030 aa8.25□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W SEC53P07283 254 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RBK1P25332 333 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MRPL17P36528 281 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W APT2P36973 181 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data8.24□□□□□ -1.09not detected
YRF1-2YER190W ROM1P53046 1155 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ARE2P53629 642 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W YML083CQ04526 418 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W RSA4P25382 515 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ARP2P32381 391 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W GIP4P39732 760 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W MET28P40573 187 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-2YER190W ATG18P43601 500 aa8.24□□□□□ -1.09
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