RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YOL107W	Q12239	342 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	LDB17	Q12342	491 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YPT6	Q99260	215 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	FUN30	P31380	1131 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SPT14	P32363	452 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GYP6	P32806	458 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ORC2	P32833	620 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TIM23	P32897	222 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CHK1	P38147	527 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CDS1	P38221	457 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YBR062C	P38239	180 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SWC5	P38326	303 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	VPS45	P38932	577 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YDR476C	Q03362	224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SWF1	Q04629	336 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GAL83	Q04739	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NDE2	Q07500	545 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SNA4	Q07549	140 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ATG31	Q12421	196 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CTT1	P06115	562 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ENA1	P13587	1091 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SPO11	P23179	398 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YCR101C	P25607	182 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	THI4	P32318	326 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SRP101	P32916	621 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	REC104	P33323	182 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PET10	P36139	283 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PCA1	P38360	1216 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YDR089W	P38966	869 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CSM2	P40465	213 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ASG1	P40467	964 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
DOA4	YDR069C	NMD5	P46970	1048 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MTC3	P53077	123 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NMA2	P53204	395 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	DAM1	P53267	343 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MNT4	P53745	580 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CAF40	P53829	373 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ENA2	Q01896	1091 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YDR541C	Q03049	344 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GSH2	Q08220	491 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
DOA4	YDR069C	HER1	Q12276	1246 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	AVL9	Q12500	764 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ENA5	Q12691	1091 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARG3	P05150	338 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PCK1	P10963	549 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PRP28	P23394	588 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SNT1	P25357	1226 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SED4	P25365	1065 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MTC2	P34246	357 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PFF1	P38244	976 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GIC1	P38785	314 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ATG7	P38862	630 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
DOA4	YDR069C	EXO1	P39875	702 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SOK1	P40317	901 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YRB2	P40517	327 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	FET5	P43561	622 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YFR018C	P43599	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PEX8	P53248	589 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	LSB1	P53281	241 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	HHO1	P53551	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SNO2	P53823	222 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91

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