RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 BTAF1O14981 1849 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 STIM1Q13586 685 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PTPAQ15257 358 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PKN1Q16512 942 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 USH1GQ495M9 461 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL6Q8N841 843 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CSRNP1Q96S65 589 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.8□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 FANCLQ9NW38 375 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 NRAPQ86VF7 1730 aa8.79□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 ICA1Q05084 483 aa8.79□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CALML4Q96GE6 196 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 RAB34Q9BZG1 259 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 MYH7P12883 1935 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 AP5Z1O43299 807 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 COBLO75128 1261 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ATP1A3P13637 1013 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ADCY7P51828 1080 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CERS5Q8N5B7 392 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K14Q99558 947 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.79□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 NEMFO60524 1076 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PPFIA2O75334 1257 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TECP42680 631 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 NIM1KQ8IY84 436 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ATL2Q8NHH9 583 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 MAF1Q9H063 256 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.78□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 MAGEA8P43361 318 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 RHBDL3P58872 404 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ASIC1P78348 528 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SLFN13Q68D06 897 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 TRIM73Q86UV7 250 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.78□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 SWAP70Q9UH65 585 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.78□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 GSDMDP57764 484 aa8.77□□□□□ -1
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TRPS1-208ENST00000519076 SEPT2Q15019 361 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 IQCB1Q15051 598 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC93Q567U6 631 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 NEK8Q86SG6 692 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 MLKLQ8NB16 471 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC17Q96LX7 622 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SH3GL3Q99963 347 aa8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 NEBLO76041 1014 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC10P48553 1259 aa8.77□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 BARHL2Q9NY43 387 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.77□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 PP2D1A8MPX8 630 aa8.77□□□□□ -1.01
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