RNA–Protein interactions for RNA: snR3

snR3, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR3, Length 194 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR3	snR3	YIP4	P53093	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YGR151C	P53287	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	DIP5	P53388	608 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	MRPL22	P53881	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	GRX3	Q03835	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YDR132C	Q03900	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PDS5	Q04264	1277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	RBA50	Q04418	439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	COS7	Q07788	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	IRC13	Q08630	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	MLH3	Q12083	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	AEP3	Q12089	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SGS1	P35187	1447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	MRP13	P12686	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	AFG1	P32317	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YTA12	P40341	825 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YJL163C	P46996	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SPT20	P50875	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	TLG1	Q03322	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	MED7	Q08278	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	INP53	Q12271	1107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SPO7	P18410	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	DAP2	P18962	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	AMD2	P22580	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PPH22	P23595	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	IMG1	P25626	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PHO91	P27514	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PPQ1	P32945	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PCH2	P38126	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	THI2	P38141	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	MSR1	P38714	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PIH1	P38768	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YDR089W	P38966	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ECM10	P39987	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ASG1	P40467	964 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	EPL1	P43572	832 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PTR3	P43606	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YJL132W	P47014	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	NET1	P47035	1189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SHE10	P53075	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	UBP16	Q02863	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ACL4	Q03771	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	MCA1	Q08601	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	RKI1	Q12189	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	BOS1	P25385	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	MRPL4	P36517	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YPT10	P38146	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ICS2	P38284	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SKN7	P38889	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SPT8	P38915	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YJL107C	P42947	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	AQR1	P53943	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	RAD33	Q04231	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	USV1	Q12132	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	UBX3	Q12229	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	LCB4	Q12246	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	TRP3	P00937	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	URA4	P20051	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	SPC110	P32380	944 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	IME2	P32581	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	ELO1	P39540	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	COG2	P53271	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YNL092W	P53934	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	AAT1	Q01802	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YMR130W	Q04223	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	PHO92	Q06390	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	YFH1	Q07540	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR3	snR3	CDC45	Q08032	650 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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