RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YGR021W	P53212	290 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SED5	Q01590	340 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	TRS31	Q03337	283 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	BLS1	Q06071	122 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	RSC3	Q06639	885 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	GIC2	Q06648	383 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.31	□□□□□ -1.72	not detected
YNL057W	YNL057W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	COX1	P00401	534 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	AI3	P03877	415 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	ATE1	P16639	503 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	ATG15	P25641	520 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	BUB3	P26449	341 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	BLI1	P35727	113 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YHR045W	P38775	560 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	UBA4	P38820	440 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SPC72	P39723	622 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YML6	P51998	286 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SSL2	Q00578	843 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	AAT1	Q01802	451 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	MRS2	Q01926	470 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	NUP53	Q03790	475 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	TPP1	Q03796	238 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	TRM12	Q04235	462 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	OMS1	Q06668	471 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	OPY2	Q06810	360 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	GRS2	Q06817	618 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	BDS1	Q08347	646 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	AIM44	Q99299	758 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SWI5	P08153	709 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	PMS1	P14242	873 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	CDC26	P14724	124 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YCR102C	P25608	368 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SFA1	P32771	386 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	CNS1	P33313	385 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	CKB2	P38930	258 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	MAD1	P40957	749 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YJR098C	P47139	656 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	COS12	P53053	380 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	NUT2	Q06213	157 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	ADY3	Q07732	790 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	IRC13	Q08630	104 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	AKR2	Q12013	749 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	TPO4	Q12256	659 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	GRR1	P24814	1151 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	AGP1	P25376	633 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SEA4	P38164	1038 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	MNL1	P38888	796 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	GID8	P40208	455 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YPR003C	P53394	754 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	HDA3	Q06623	655 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YNL057W	YNL057W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	ERG11	P10614	530 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	CLB1	P24868	471 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YCR099C	P25657	155 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	MKK1	P32490	508 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	MKK2	P32491	506 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	KAP122	P32767	1081 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	ORC2	P32833	620 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	TIP20	P33891	701 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	SKT5	P34226	696 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	LST4	P34239	828 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	MRP21	P38175	177 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	SMF2	P38778	549 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNL057W	YNL057W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	RIP-Chip

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.2 ms