RNA–Protein interactions for RNA: YNL046W

YNL046W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL046W, Length 519 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL046W	YNL046W	MED1	Q12321	566 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ENT1	Q12518	454 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	YOR019W	Q99248	730 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SEM1	O94742	89 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	AGA1	P32323	725 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SRB5	P32585	307 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	MIC60	P36112	540 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ALY1	P36117	915 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ESL2	P36168	1195 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	YIL060W	P40519	144 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SWP82	P43554	623 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	YDL186W	P48568	277 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	BSC5	P53755	489 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	YSA1	Q01976	231 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	CRN1	Q06440	651 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	NUS1	Q12063	375 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	MET8	P15807	274 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	TFC3	P34111	1160 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	BLI1	P35727	113 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	YER130C	P39959	443 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SLZ1	P40167	298 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	RGI2	P40188	164 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	NDE1	P40215	560 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ESL1	P40456	1118 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	IME4	P41833	600 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	AAD10	P47182	288 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	PKP2	P53170	491 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	MUB1	Q03162	620 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	TLG1	Q03322	224 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	RAD30	Q04049	632 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SDH5	Q08230	162 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	NBP2	Q12163	236 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ERP4	Q12450	207 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SKM1	Q12469	655 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	KAR3	P17119	729 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	OPI1	P21957	404 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ATS1	P31386	333 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	ECM10	P39987	644 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	YFR020W	P43600	232 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	MDM1	Q01846	1127 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL046W	YNL046W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	YCK1	P23291	538 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	SPC34	P36131	295 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	PHO90	P39535	881 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	YJL213W	P40896	331 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	TIM10	P87108	93 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	NGL3	Q03210	505 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	RTP1	Q12751	981 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	YBR085C-A	O43137	85 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	SGF29	P25554	259 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	CAB3	P36076	571 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	RRT2	P38332	387 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	IKS1	P47042	667 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	RSM28	Q03430	361 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	SKG3	Q06315	1026 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	FMP45	Q07651	309 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	CDC15	P27636	974 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	PHD1	P36093	366 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	MUM2	P38236	366 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	YBR225W	P38321	900 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	SLX1	P38324	304 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	NPR2	P39923	615 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	RPH1	P39956	796 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	MRX6	P48564	524 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	INA17	Q02888	182 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	YOL159C	Q08300	171 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	HUA2	Q12134	243 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	SPE4	Q12455	300 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	INH1	P01097	85 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	PRE8	P23639	250 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL046W	YNL046W	GAC1	P28006	793 aa		2.74	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.1 ms