RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	TKL2	P33315	681 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YKL151C	P36059	337 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ATG14	P38270	344 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MTG2	P38860	518 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LYS9	P38999	446 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	POL31	P46957	487 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PEX10	Q05568	337 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ESA1	Q08649	445 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SKM1	Q12469	655 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SCJ1	P25303	377 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YBR063C	P38083	404 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FMC1	P40491	155 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SNZ3	P43545	298 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RTT101	P47050	842 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LOH1	P47055	219 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YNR061C	P53747	219 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SNZ2	P53824	298 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MET31	Q03081	177 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	OSW1	Q08692	278 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	APC9	Q12107	265 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SIR3	P06701	978 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YML002W	P0CF17	737 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	APN1	P22936	367 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PPH22	P23595	377 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CTR86	P25355	563 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ECM25	P32525	599 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	APT2	P36973	181 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MRP21	P38175	177 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	JLP2	P40206	208 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TMA108	P40462	946 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YRB2	P40517	327 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	APS3	P47064	194 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YGR168C	P53293	376 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ATF2	P53296	535 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YNL095C	P53932	642 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FAR10	Q06001	478 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RSC2	Q06488	889 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	NUS1	Q12063	375 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RHO2	P06781	192 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TEC1	P18412	486 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	IME1	P21190	360 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MNE1	P24720	663 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FUN30	P31380	1131 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YLF2	P38746	405 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RGA1	P39083	1007 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BIT61	P47041	543 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TAH11	P47112	604 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YJR098C	P47139	656 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DIE2	P50076	525 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TAM41	P53230	385 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CAF120	P53836	1060 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ASI2	P53895	289 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	OSH6	Q02201	448 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BSP1	Q06604	576 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.28	□□□□□ -1.88	not detected
RRP5	YMR229C	UAF30	Q08747	228 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GPM2	Q12008	311 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DCC1	P25559	380 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ITR1	P30605	584 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	AST1	P35183	429 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FUI1	P38196	639 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YHR131C	P38835	850 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	AVT2	P39981	480 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PRK1	P40494	810 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MAF1	P41910	395 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BRE2	P43132	505 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BNA6	P43619	295 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MAD3	P47074	515 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SWC4	P53201	476 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GCN5	Q03330	439 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SEG1	Q04279	960 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RAD59	Q12223	238 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MDY2	Q12285	212 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89

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