RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	MRX6	P48564	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YAT1	P80235	687 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	ECM7	Q06200	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SHS1	Q07657	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	TRA1	P38811	3744 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CBS1	P14066	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CLC1	P17891	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	ATP12	P22135	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	PPH22	P23595	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CWH43	P25618	953 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YBR056W	P38081	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	FAT1	P38225	669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	MUP3	P38734	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RRM3	P38766	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	REV7	P38927	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	LYS9	P38999	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	FET5	P43561	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RET3	P53600	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	ARK1	P53974	638 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	HER2	Q03557	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	BCP1	Q06338	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	TCO89	Q08921	799 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	ENV7	Q12003	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	VPS54	Q12071	889 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RBD2	Q12270	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	HRT3	Q12347	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	NSI1	Q12457	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CTF3	Q12748	733 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	GAL80	P04387	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CDC42	P19073	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CPR2	P23285	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SPS22	P25380	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	BOS1	P25385	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	DGR2	P32330	852 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SET3	P36124	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	UTH1	P36135	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	EXO5	P38289	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	FLC2	P39719	783 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YIL165C	P40446	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	MMM1	P41800	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YNL165W	P53891	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YSA1	Q01976	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SMA1	Q02651	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RKM2	Q03942	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RRN11	Q04712	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CRN1	Q06440	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CDD1	Q06549	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	FMP45	Q07651	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
RFU1	YLR073C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	YIG1	Q08956	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	GLE1	Q12315	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	AVL9	Q12500	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	AFI1	Q99222	893 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	DIF1	O13577	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	STE12	P13574	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	RPC31	P17890	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
RFU1	YLR073C	GAC1	P28006	793 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	SRP101	P32916	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	STE13	P33894	931 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFU1	YLR073C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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