RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR213W	YHR213W	YNL050C	P53952	270 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YHR213W	YHR213W	YDL144C	Q07589	356 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YHR213W	YHR213W	ALE1	Q08548	619 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YHR213W	YHR213W	SSP2	Q08646	371 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YHR213W	YHR213W	TRM8	Q12009	286 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YHR213W	YHR213W	VCX1	Q99385	411 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YHR213W	YHR213W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YCR006C	P25350	157 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SSH4	P32343	579 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SRB5	P32585	307 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RRN3	P36070	627 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	AXL2	P38928	823 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YND1	P40009	630 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YER010C	P40011	234 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	MRX1	P40050	688 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	VPS4	P52917	437 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	IZH1	Q03419	316 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	ARP9	Q05123	467 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	NUS1	Q12063	375 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	NBP2	Q12163	236 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	ERG8	P24521	451 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RER1	P25560	188 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YNL181W	P53878	407 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RCO1	Q04779	684 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	GPA1	P08539	472 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	MRP20	P32387	263 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	UBP13	P38187	747 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	PSD1	P39006	500 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SWP82	P43554	623 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
YHR213W	YHR213W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SNO4	Q04902	237 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	OPY2	Q06810	360 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RTT109	Q07794	436 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	PSK2	Q08217	1101 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	FRE3	Q08905	711 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	HSP32	Q08992	237 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CDC23	P16522	626 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CBF2	P32504	956 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	ECM10	P39987	644 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CTK2	P46962	323 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CBK1	P53894	756 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	ESBP6	P53918	673 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	PFA5	Q03289	374 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RSM28	Q03430	361 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YLR455W	Q06188	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YOR019W	Q99248	730 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	TOA1	P32773	286 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	EFM2	P38347	419 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YJR061W	P40355	935 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	IME4	P41833	600 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YGL082W	P53155	381 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CUL3	P53202	744 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CRZ1	P53968	678 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CDC45	Q08032	650 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	CBP1	P07252	654 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	PET111	P08468	800 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RAP1	P11938	827 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	RAD24	P32641	659 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	ALY1	P36117	915 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SLZ1	P40167	298 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YJL070C	P40361	888 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YFR020W	P43600	232 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	EAF6	P47128	113 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YNR061C	P53747	219 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	MUB1	Q03162	620 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YHR213W	YHR213W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.16	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.1 ms