RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A YSA1Q01976 231 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YMR160WQ03823 816 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A MSS11Q03825 758 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RAD30Q04049 632 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TMA64Q04600 565 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SSK1Q07084 712 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RTT109Q07794 436 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A GRC3Q07845 632 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A CSR2Q12734 1121 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YML002WP0CF17 737 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YKL100CP34248 587 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A MAL33P38157 468 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YTA12P40341 825 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RPS10BP46784 105 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A MEP3P53390 489 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A EFM6P53970 246 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YVH1Q02256 364 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A DPB4Q04603 196 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RTT103Q05543 409 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ECM30Q06673 1274 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TEN1Q07921 160 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YEH2Q07950 538 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SDH5Q08230 162 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A DAP1Q12091 152 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TIP41Q12199 356 aa2.47□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YIH1P25637 258 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CHS3P29465 1165 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A ACH1P32316 526 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A MCM10P32354 571 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A ROT2P38138 954 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YBL029WP38201 376 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YJL068CP40363 299 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A AXL1P40851 1208 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PTR3P43606 678 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A RSM23Q01163 450 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YML037CQ03703 340 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YKU80Q04437 629 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YPL272CQ08984 517 aa2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CDC16P09798 840 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SUI2P20459 304 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A BOS1P25385 244 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A IMG1P25626 169 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A VPS17P32913 551 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YNK1P36010 153 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YKL023WP36103 277 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A NUP133P36161 1157 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YER130CP39959 443 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A LYS4P49367 693 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A APT1P49435 187 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SAM50P53969 484 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A FMP45Q07651 309 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YBR126W-AQ8TGU7 68 aa2.45□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A KAR3P17119 729 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SYN8P31377 255 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PRO3P32263 286 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A ECM15P35195 104 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A ICS2P38284 255 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CIN4P39110 191 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YEL068CP39977 110 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A LYS14P40971 790 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A ALT2P52892 507 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A DUG3P53871 357 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A RHO4Q00246 291 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YPL014WQ02606 381 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A DIC1Q06143 298 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A THI20Q08224 551 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PPT2Q12036 173 aa2.44□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SEM1O94742 89 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SEC62P21825 274 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YCK1P23291 538 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A RPS2P25443 254 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SGF29P25554 259 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PAH1P32567 862 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A MDM31P38880 579 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A AFG3P39925 761 aa2.43□□□□□ -2.02
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