RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B SLM5P25345 492 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ADY2P25613 283 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TAF5P38129 798 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HXT5P38695 592 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MUP3P38734 546 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SMK1P41808 388 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YJL107CP42947 387 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MNP1P53163 194 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MEP3P53390 489 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CWC15Q03772 175 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B AIM36Q03798 255 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B BUD22Q04347 519 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MDM38Q08179 573 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.58□□□□□ -2.5not detected
YHL009W-BYHL009W-B YPL264CQ08980 353 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RLF2Q12495 606 aa-0.58□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B STF1P01098 86 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RAD7P06779 565 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CDC21P06785 304 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B LEU1P07264 779 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CHS1P08004 1131 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ILS1P09436 1072 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ELO2P25358 347 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CHS3P29465 1165 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B AFG2P32794 780 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SKG6P32900 734 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B NIC96P34077 839 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GMH1P36125 273 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YER079WP40052 210 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B VID27P40157 782 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SEC24P40482 926 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TY4A-JP47023 414 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YGR149WP48236 432 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B UPF3P48412 387 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B VAC7P53950 1165 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TIM10P87108 93 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GIP3Q03016 1276 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MRX11Q03079 207 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B NGL2Q03264 515 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B UTP15Q04305 513 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PLM2Q04383 521 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MRX8Q05473 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SWA2Q06677 668 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RTT10Q08924 1013 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CRC1Q12289 327 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PDH1Q12428 516 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RVB2Q12464 471 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SKM1Q12469 655 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ADH3P07246 375 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YHR032W-AP0C5N6 59 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.59□□□□□ -2.5not detected
YHL009W-BYHL009W-B CDC48P25694 835 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GCD6P32501 712 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RIB5P38145 238 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YHL017WP38745 532 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YND1P40009 630 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PIG2P40187 538 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B DFG10P40526 253 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B AVT4P50944 713 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HOS2P53096 452 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B POP6P53218 158 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FMP48P53233 369 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SED1Q01589 338 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SVL3Q03088 825 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MMR1Q06324 491 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B OSW1Q08692 278 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ISA2Q12425 185 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YHR214C-EQ8TGK0 99 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RAD10P06838 210 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YAR066WP0CX18 203 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YHR214WP0CX19 203 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ABF1P14164 731 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GEX1P25596 615 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RPL8BP29453 256 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GPI10P30777 616 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B DCG1P32460 244 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HBS1P32769 611 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PXA2P34230 853 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FRE2P36033 711 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ALY1P36117 915 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YKR078WP36158 585 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GEX2P36173 615 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B IFA38P38286 347 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SSF1P38789 453 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RMD8P43620 662 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PIR5P46999 287 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YJL118WP47022 219 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YGR122WP53272 402 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GTR2P53290 341 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CTR9P89105 1077 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RNT1Q02555 471 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PIG1Q06216 648 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ATO3Q12359 275 aa-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RIB2Q12362 591 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
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