RNA–Protein interactions for RNA: YGL195W

GCN1, Transcript of Positive regulator of the Gcn2p kinase activity, yeast

Gene GCN1, Length 8,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN1	YGL195W	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ACO2	P39533	789 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	FMC1	P40491	155 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	GCD10	P41814	478 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RSN1	Q03516	953 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	PMT7	Q06644	662 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ESA1	Q08649	445 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SEN2	P16658	377 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MIH1	P23748	554 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	YIH1	P25637	258 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SGE1	P33335	543 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	APT2	P36973	181 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	HEH2	Q03281	663 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	YML108W	Q03759	105 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	NBP2	Q12163	236 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SKM1	Q12469	655 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MSS51	P32335	436 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	CDC27	P38042	758 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ARA1	P38115	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SER3	P40054	469 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SIP4	P46954	829 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	KTR6	P54070	446 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	DID2	P69771	204 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	TLG1	Q03322	224 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MSC2	Q03455	724 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SPE1	P08432	466 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	KAR1	P11927	433 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SAN1	P22470	610 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RGT1	P32862	1170 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	UBP11	P36026	717 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ARN1	P38731	627 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MEP2	P41948	499 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	NUS1	Q12063	375 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RBD2	Q12270	262 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	PET127	P32606	800 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	PXA2	P34230	853 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	UBP5	P39944	805 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	STB4	P50104	949 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SLD3	P53135	668 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	YNR068C	P53754	272 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
GCN1	YGL195W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MNL2	Q12205	849 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SFM1	Q12314	213 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	GIS3	Q12418	502 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MST1	P07236	462 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	LDH1	P38139	375 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	TSC10	P38342	320 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	AIM18	P38884	321 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SEO1	P39709	593 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	CDC1	P40986	491 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RRT5	P43607	289 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	VPS25	P47142	202 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	IRC15	Q02733	499 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	GET4	Q12125	312 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	PRP28	P23394	588 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MLH1	P38920	769 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ERP2	P39704	215 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	DDI1	P40087	428 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	YJR061W	P40355	935 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	CSN12	P47130	423 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	FPK1	P53739	893 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	BSC2	Q05611	235 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	COQ9	Q05779	260 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	FLC1	Q08967	793 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	PDE1	P22434	369 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	TIM23	P32897	222 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RIM2	P38127	377 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	LEM3	P42838	414 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	JAC1	P53193	184 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	FAR10	Q06001	478 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	SAM3	Q08986	587 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	TEC1	P18412	486 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ATO2	P32907	282 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	BSD2	P38356	321 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	ALG8	P40351	577 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	TRM82	Q03774	444 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	MDM32	Q12171	622 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GCN1	YGL195W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms