RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT105	YER104W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	CUL3	P53202	744 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YGR127W	P53275	312 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	COQ6	P53318	479 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	AAT1	Q01802	451 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YPL107W	Q02873	248 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PLM2	Q04383	521 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YML053C	Q04978	212 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	RSF1	Q05043	376 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.16	□□□□□ -1.9	not detected
RTT105	YER104W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	NFI1	Q12216	726 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YML133C	Q03099	1374 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	STF1	P01098	86 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SPE2	P21182	396 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ERV1	P27882	189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	NIP100	P33420	868 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	LTV1	P34078	463 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HCS1	P34243	683 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	UIP5	P36137	443 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MNN2	P38069	597 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	EFM4	P40516	257 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SMC3	P47037	1230 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YGR111W	P53265	400 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	DON1	Q05610	365 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ATG9	Q12142	997 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	FRE6	Q12473	712 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	CTF3	Q12748	733 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SGS1	P35187	1447 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SNT1	P25357	1226 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	IMG1	P25626	169 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
RTT105	YER104W	MSP1	P28737	362 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	GSH1	P32477	678 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YME2	P32843	850 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HEL1	P36113	551 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	FTH1	P38310	465 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RRT2	P38332	387 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YHR054C	P38780	354 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ELO1	P39540	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PAC2	P39937	518 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MEP1	P40260	492 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	OPT1	P40897	799 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	CPR8	P53728	308 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	IPI3	P53877	555 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MPS1	P54199	764 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	WAR1	Q03631	944 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RIM13	Q03792	727 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RAD33	Q04231	177 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PCL8	Q08966	492 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RGT2	Q12300	763 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HSP42	Q12329	375 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TPK2	P06245	380 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YML002W	P0CF17	737 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MRP13	P12686	339 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	BOS1	P25385	244 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MRPL9	P31334	269 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SMI1	P32566	505 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RML2	P32611	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YME1	P32795	747 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	DAD2	P36162	133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PIM1	P36775	1133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YMC2	P38087	329 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MUP3	P38734	546 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RRF1	P38771	230 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MIT1	P40002	666 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YFR020W	P43600	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PTR3	P43606	678 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	URB2	P47108	1174 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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