RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CAN1	P04817	590 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FBP1	P09201	348 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PHO8	P11491	566 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	WHI2	P12611	486 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YPK2	P18961	677 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RAD24	P32641	659 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SMF2	P38778	549 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	LNP1	P38878	278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	VMA7	P39111	118 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GDH3	P39708	457 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SSO2	P39926	295 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NUP82	P40368	713 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SNF12	P53628	566 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ERG5	P54781	538 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MUK1	Q02866	612 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YDR249C	Q03787	373 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SND1	Q04007	877 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RAD30	Q04049	632 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ARP10	Q04549	284 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	DCN1	Q12395	269 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SEC62	P21825	274 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RIT1	P23796	513 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TFC1	P32367	649 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YKL151C	P36059	337 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NUP133	P36161	1157 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	BMT2	P38278	337 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MND1	P53102	219 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SLI1	P53304	468 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MPS1	P54199	764 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	VPS74	Q06385	345 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	DIN7	Q12086	430 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	APC1	P53886	1748 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RAD10	P06838	210 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CIT2	P08679	460 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ATR1	P13090	542 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YAK1	P14680	807 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	JEN1	P36035	616 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PCL7	P40186	285 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SLM1	P40485	686 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PKP1	P40530	394 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	IRC24	P40580	263 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SAE2	P46946	345 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPC17	P47076	161 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TWF1	P53250	332 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HOL1	P53389	586 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HDA1	P53973	706 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SRT1	Q03175	343 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YMR279C	Q03263	540 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RAX1	Q08760	435 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FRE5	Q08908	694 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FEX1	Q08913	375 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RUP1	Q12242	671 aa		3.15	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	URA3	P03962	267 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MRP13	P12686	339 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	POL3	P15436	1097 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NAM9	P27929	486 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YPK3	P38070	525 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	COS111	P38308	924 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RIM4	P38741	713 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YER158C	P40095	573 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MDE1	P47095	244 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGR237C	P50089	785 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MLC1	P53141	149 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	OKP1	P53298	406 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	UFO1	Q04511	668 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GMC2	Q06201	188 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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