RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W CBF2P32504 956 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YET1P35723 206 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SIP3P38717 1229 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W NPR2P39923 615 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W IMO32P53219 342 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W COQ6P53318 479 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TGL2P54857 326 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W MUB1Q03162 620 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TRI1Q05024 226 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W OSW1Q08692 278 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W BUD7Q08754 746 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W IES3Q12345 250 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W BET2P20133 325 aa3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RIT1P23796 513 aa3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TGL1P34163 548 aa3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PXL1P36166 706 aa3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W UBP13P38187 747 aa3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W EFM4P40516 257 aa3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W LSG1P53145 640 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TAH18Q12181 623 aa3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W OPI1P21957 404 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W VPS34P22543 875 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PEX2P32800 271 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MRE11P32829 692 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W NIC96P34077 839 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YBR062CP38239 180 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PCI8P40512 444 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YML108WQ03759 105 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ARG7Q04728 441 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W TAF9Q05027 157 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W COQ11Q05892 277 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YLH47Q06493 454 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PSK2Q08217 1101 aa3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PIF1P07271 859 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MTF2P10849 440 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W REC107P21651 314 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ERG7P38604 731 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W NGL3Q03210 505 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PPM1Q04081 328 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MSH5Q12175 901 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W POM152P39685 1337 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ANP1P32629 500 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W KDX1P36005 433 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ADE17P38009 592 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W CCT2P39076 527 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SAP185P40856 1058 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ASK10P48361 1146 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SAP4P53036 818 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W TAF10Q12030 206 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W APC2Q12440 853 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MPD2Q99316 277 aa3.95□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PMA2P19657 947 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W PWP1P21304 576 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W CBP3P21560 335 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W RAD57P25301 460 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W AAD3P25612 363 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W NUP120P35729 1037 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W EFM2P38347 419 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SPC72P39723 622 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W STB2P46679 850 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W BRO1P48582 844 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W HOF1Q05080 669 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SUE1Q06524 206 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W NSE1Q07913 336 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YPR089WO13585 888 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W HIS3P06633 220 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SPO12P17123 173 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W VPH2P32341 215 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SRB4P32569 687 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YPT53P36019 220 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W DBP7P36120 742 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YPT10P38146 199 aa3.94□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MUM2P38236 366 aa3.94□□□□□ -1.78
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