RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	LDB18	Q07887	179 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PFA4	Q12006	378 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	DFG16	Q99234	619 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	CDC9	P04819	755 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	TUP1	P16649	713 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YCL042W	P25572	119 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	DOM34	P33309	386 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	SKN1	P33336	771 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PET112	P33893	541 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	AIM18	P38884	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YJR030C	P47101	745 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ECL1	P48235	211 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	COG1	P53079	417 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YGR111W	P53265	400 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	VPS9	P54787	451 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RSF1	Q05043	376 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	TGL5	Q12043	749 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	FRT1	Q99332	602 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	DCC1	P25559	380 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	IMG1	P25626	169 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	GSY2	P27472	705 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	AEP1	P32493	518 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RFX1	P48743	811 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	FRE4	P53746	719 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ERV41	Q04651	352 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	TPO1	Q07824	586 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	FLP1	P03870	423 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
SYF2	YGR129W	URA4	P20051	364 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	EMC1	P25574	760 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	MCM2	P29469	868 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	MIA40	P36046	403 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YHR033W	P38690	423 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	DBP8	P38719	431 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PCL5	P38794	229 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	BDH2	P39713	417 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	KHA1	P40309	873 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YSR3	P23501	404 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ADH7	P25377	361 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YEL073C	P39974	107 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	SAP4	P53036	818 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	NNF2	P53253	936 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	HST1	P53685	503 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	CDC14	Q00684	551 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RRN11	Q04712	507 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	DIN7	Q12086	430 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	SFL1	P20134	766 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	CLN1	P20437	546 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	VPS34	P22543	875 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YCR015C	P25616	317 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	MSH1	P25846	959 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	MEI4	P29467	408 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PET127	P32606	800 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	GDA1	P32621	518 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	FTH1	P38310	465 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YHR210C	P38893	341 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ELP2	P42935	788 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	GND2	P53319	492 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	AAD15	Q08361	143 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	BUD7	Q08754	746 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	JNM1	P36224	373 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YHR182W	P38870	785 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	IRR1	P40541	1150 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YJL107C	P42947	387 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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