RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	RIA1	P53893	1110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	TOF2	Q02208	771 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	FIN1	Q03898	291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	UBX3	Q12229	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	HIP1	P06775	603 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	MRP13	P12686	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	VMA16	P23968	213 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	AFG1	P32317	509 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	SRB2	P34162	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	YKR073C	P36153	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	AFG3	P39925	761 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	RPN14	P53196	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	APN1	P22936	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	VPS17	P32913	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	NIP100	P33420	868 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	HCS1	P34243	683 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	YBR053C	P38235	358 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	ELO3	P40319	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	YIR042C	P40586	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	MSY1	P48527	492 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	EFM6	P53970	246 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	TAP42	Q04372	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	BAG7	Q12128	409 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	SGS1	P35187	1447 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	PHO91	P27514	894 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	TUL1	P36096	758 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	MIC60	P36112	540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	PIM1	P36775	1133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	CTP1	P38152	299 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	WSS1	P38838	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	ALG5	P40350	334 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	YNL092W	P53934	400 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	VTC3	Q02725	835 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	ACL4	Q03771	387 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	PPM1	Q04081	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEO1	YAL067C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PCT1	P13259	424 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	NTH1	P32356	751 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	HES1	P35843	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MRPL40	P36534	297 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MLH1	P38920	769 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	VPS45	P38932	577 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	BUR6	P40096	142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	NPA3	P47122	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ECM27	P47144	725 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	IPI3	P53877	555 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RSM28	Q03430	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RTT109	Q07794	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MED7	Q08278	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	FRE3	Q08905	711 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	VPS54	Q12071	889 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	TAF3	Q12297	353 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	LAS17	Q12446	633 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	COX1	P00401	534 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	AMD2	P22580	549 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PPH22	P23595	377 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ADH7	P25377	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	CNE1	P27825	502 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ELF1	P36053	145 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MEF2	P39677	819 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YIL089W	P40500	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	STB2	P46679	850 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	NET1	P47035	1189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	AMA1	P50082	593 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YGR130C	P53278	816 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ATG9	Q12142	997 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	GRR1	P24814	1151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YBR144C	P34215	104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YPT10	P38146	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PLB1	P39105	664 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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