RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 TRAPPC10P48553 1259 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2H3Q13889 308 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 REC114Q7Z4M0 266 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF280CQ8ND82 737 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SLIT3O75094 1523 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA12O60330 932 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ATF3P18847 181 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MCM4P33991 863 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 KCNQ4P56696 695 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FAM160A1Q05DH4 1040 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ESCO1Q5FWF5 840 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GPR158Q5T848 1215 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2U1Q7Z449 544 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 KIF18BQ86Y91 864 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CPA6Q8N4T0 437 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TIFAQ96CG3 184 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ELP3Q9H9T3 547 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 USP25Q9UHP3 1055 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 HCN2Q9UL51 889 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CCNFP41002 786 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CLN3Q13286 438 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP27Q5VZP5 1158 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PASD1Q8IV76 773 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TM9SF2Q99805 663 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 YIPF4Q9BSR8 244 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CSRNP2Q9H175 543 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM75PA6NK02 468 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ASGR2P07307 311 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN3P20807 821 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN7P41732 249 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RUFY4Q6ZNE9 571 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PDZD3Q86UT5 571 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 USP33Q8TEY7 942 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PKNOX2Q96KN3 472 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TBATAQ96M53 351 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ERBINQ96RT1 1412 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TM4SF5O14894 197 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 IMPDH2P12268 514 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CASP2P42575 452 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4F3Q08477 520 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DRC7Q8IY82 874 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SCLYQ96I15 445 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PDLIM7Q9NR12 457 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TRAK1Q9UPV9 953 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJA2O60884 412 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ATP4AP20648 1035 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MECP2P51608 486 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CENPCQ03188 943 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH1L2Q3SY69 923 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PKN3Q6P5Z2 889 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP161Q6P656 301 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TTC6Q86TZ1 520 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 NELL1Q92832 810 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 OSBP2Q969R2 916 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ORAI2Q96SN7 254 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CARD14Q9BXL6 1004 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 BRMS1Q9HCU9 246 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SEC31BQ9NQW1 1179 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FAM13BQ9NYF5 915 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DNM3Q9UQ16 869 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PSME4Q14997 1843 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SUSD5O60279 629 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PRKD3O94806 890 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RBP3P10745 1247 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FGFR1P11362 822 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms