RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C AXL2P38928 823 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C IST3P40565 148 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ASE1P50275 885 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CUL3P53202 744 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YLR302CO13544 120 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C HNM1P19807 563 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SSH4P32343 579 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C BZZ1P38822 633 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C PSD1P39006 500 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YER010CP40011 234 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RIC1P40395 1056 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SAD1P43589 448 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YNL181WP53878 407 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C REG1Q00816 1014 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TAH18Q12181 623 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CBP1P07252 654 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ERG8P24521 451 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RER1P25560 188 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ADE17P38009 592 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YPK3P38070 525 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C UBP13P38187 747 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C VID27P40157 782 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C HXT9P40885 567 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ATG27P46989 271 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C DCP2P53550 970 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SNO4Q04902 237 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SWA2Q06677 668 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C HSP33Q08914 237 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C HSP32Q08992 237 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ERG27Q12452 347 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SUI3P09064 285 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CLB2P24869 491 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YJL070CP40361 888 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C PFK26P40433 827 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CBK1P53894 756 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YMR018WQ04364 514 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CRN1Q06440 651 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YOL087CQ99247 1116 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C VCX1Q99385 411 aa1.98□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C PET111P08468 800 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C BAR1P12630 587 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C MCM10P32354 571 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SRB5P32585 307 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RAD24P32641 659 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TFC3P34111 1160 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C AAP1P37898 856 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C VPS4P52917 437 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C MEP3P53390 489 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SVL3Q03088 825 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C FCP1Q03254 732 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ARP10Q04549 284 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RSF1Q05043 376 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C OPY2Q06810 360 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YLR049CQ12110 428 aa1.97□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TKL1P23254 680 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MGR1P25573 417 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MRP20P32387 263 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C CBF2P32504 956 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RPN2P32565 945 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YOX1P34161 385 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SDS24P38314 527 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C DPH1P40487 425 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SWP82P43554 623 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C CTK2P46962 323 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YNR061CP53747 219 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RCO1Q04779 684 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PSK2Q08217 1101 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C NUS1Q12063 375 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YOR019WQ99248 730 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C FUM1P08417 488 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RPB2P08518 1224 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PMS1P14242 873 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C CDC15P27636 974 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C LHS1P36016 881 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C NTR2P36118 322 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C FMP10P40098 244 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C IME4P41833 600 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C FET5P43561 622 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C IMP4P53941 290 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SMA1Q02651 245 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MCP2Q06567 569 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YDL121CQ07541 149 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C NBP2Q12163 236 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C NKP1Q12493 238 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa1.96□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SAC1P32368 623 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SOF1P33750 489 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ALY1P36117 915 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ARP1P38696 384 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MRX1P40050 688 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YJR061WP40355 935 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YIR014WP40570 242 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RTS2P40962 232 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C IAH1P41734 238 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MUB1Q03162 620 aa1.95□□□□□ -2.1
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