RNA–Protein interactions for RNA: YOR242C

SSP2, Transcript of Sporulation specific protein that localizes to the spore wall, yeast

Gene SSP2, Length 1,116 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP2	YOR242C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	LEU5	P38702	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	AXL2	P38928	823 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	IML2	P47031	731 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	VPS4	P52917	437 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YNL234W	P53857	426 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	EDE1	P34216	1381 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	CDC15	P27636	974 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	STV1	P37296	890 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	IME4	P41833	600 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	NNF2	P53253	936 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	BET4	Q00618	327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	ECI1	Q05871	280 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	NUS1	Q12063	375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	CLB2	P24869	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	MRP20	P32387	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YER010C	P40011	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	HXT9	P40885	567 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	SNO4	Q04902	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	HSP32	Q08992	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YUR1	P26725	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	GCS1	P35197	352 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	FMP10	P40098	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	STB2	P46679	850 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YML131W	Q03102	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	PDR3	P33200	976 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	ALY1	P36117	915 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	SAD1	P43589	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YNL181W	P53878	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	MAK10	Q02197	733 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	ARP10	Q04549	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	ATG9	Q12142	997 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	MGR1	P25573	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	EFM2	P38347	419 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	EKI1	Q03764	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	RPB8	P20436	146 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YND1	P40009	630 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YIL060W	P40519	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	PKP1	P40530	394 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	SMA1	Q02651	245 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	RCO1	Q04779	684 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSP2	YOR242C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	SLZ1	P40167	298 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	MAF1	P41910	395 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	MUB1	Q03162	620 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	FMP42	Q04991	504 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	GRS2	Q06817	618 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	SSP2	Q08646	371 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	NDD1	Q08887	554 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	RRN3	P36070	627 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	YPK3	P38070	525 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	YAT2	P40017	923 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	NRT1	Q08485	598 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	INP53	Q12271	1107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	HNM1	P19807	563 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	CBF2	P32504	956 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	RTS2	P40962	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	CBK1	P53894	756 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	INN1	P53901	409 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	ENT4	Q07872	247 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	MIA40	P36046	403 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	RKM3	P38222	552 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	ANS1	P38832	159 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	BUR6	P40096	142 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	YJR061W	P40355	935 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	PKP2	P53170	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	APL4	Q12028	832 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	BSC1	Q12140	328 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	NBP2	Q12163	236 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	RAD24	P32641	659 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	FET5	P43561	622 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSP2	YOR242C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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