RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	LAM1	P38851	1228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AVT2	P39981	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YAT2	P40017	923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SAD1	P43589	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RRT5	P43607	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	NUP84	P52891	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ERP6	P53198	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	NMA2	P53204	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PEX13	P80667	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PSR1	Q07800	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GPM2	Q12008	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ATG34	Q12292	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TAF3	Q12297	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	CLB4	P24871	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SPS22	P25380	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PEX2	P32800	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SRP101	P32916	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	NUP120	P35729	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	DRE2	P36152	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MRPL7	P36519	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YBR259W	P38338	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TSC10	P38342	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PPE1	P38796	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BZZ1	P38822	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	STL1	P39932	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HOS4	P40480	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	IAH1	P41734	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GUF1	P46943	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ASG7	P46993	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SPC98	P53540	846 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BET4	Q00618	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ATP12	P22135	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SNT1	P25357	1226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	GID7	P25569	745 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SPR1	P32603	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HMT1	P38074	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YBR053C	P38235	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YBP1	P38315	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MEF2	P39677	819 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	USE1	P53146	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	COS6	P53344	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	KTR6	P54070	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SPO19	Q03029	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	GCN5	Q03330	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	BCP1	Q06338	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	DDC1	Q08949	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SUT2	Q12286	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	FRT1	Q99332	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	NPP1	P25353	742 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YCL068C	P25593	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YIH1	P25637	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	DSS4	P32601	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ATG14	P38270	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PHO89	P38361	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YHL041W	P38730	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YHR182W	P38870	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	VAC8	P39968	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YEL028W	P39989	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PSF2	P40359	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CHS6	P40955	746 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RTT101	P47050	842 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MAD3	P47074	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YGR127W	P53275	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	BUD32	P53323	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	EFM6	P53970	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ULP1	Q02724	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	NHX1	Q04121	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HRD3	Q05787	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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