RNA–Protein interactions for RNA: YLR373C

VID22, Transcript of Glycosylated integral membrane protein localized to plasma membrane, yeast

Gene VID22, Length 2,706 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VID22	YLR373C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	NHA1	Q99271	985 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SRB2	P34162	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	MSC7	P38694	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PTR3	P43606	678 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	MTC3	P53077	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PUS2	P53167	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SNF12	P53628	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PEX12	Q04370	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	AIM39	Q08223	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TRE2	Q08693	809 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	THI21	Q08975	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TPK1	P06244	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	STE3	P06783	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	MSS18	P08593	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	FBP1	P09201	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	DBF2	P22204	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	GAC1	P28006	793 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	HCS1	P34243	683 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	GEM1	P39722	662 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	LAS21	P40367	830 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TWF1	P53250	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	ZRG17	P53735	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	STP1	Q00947	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TAF11	Q04226	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TRM12	Q04235	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	URC2	Q04411	772 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	MED2	Q12124	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	OSW2	Q12202	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	HER1	Q12276	1246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	HSP42	Q12329	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	COX4	P04037	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PDE2	P06776	526 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	UGA1	P17649	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	YKL222C	P35995	705 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	CYC2	P38909	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	XDJ1	P39102	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	NPP2	P39997	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	FCY21	P40039	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TIR3	P40552	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	AIM23	P47015	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SDH1	Q00711	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	RMI1	Q02685	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SWP1	Q02795	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	HMG2	P12684	1045 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PUP1	P25043	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PPZ1	P26570	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	FUN30	P31380	1131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	AEP1	P32493	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	COT1	P32798	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	CLG1	P35190	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SKG1	P36169	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	PIM1	P36775	1133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	RDH54	P38086	958 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	VMA7	P39111	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	FET5	P43561	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	RMD8	P43620	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
VID22	YLR373C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SLD5	Q03406	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	YML037C	Q03703	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	RSA1	Q08932	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	VPS54	Q12071	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	UPC2	Q12151	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	FMP16	Q12497	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VID22	YLR373C	SRP101	P32916	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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