RNA–Protein interactions for RNA: YGL224C

SDT1, Transcript of Pyrimidine nucleotidase, yeast

Gene SDT1, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SDT1	YGL224C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
SDT1	YGL224C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	GSH1	P32477	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	NPL6	P32832	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	RGI2	P40188	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	VTC2	P43585	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	FAR3	P46671	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	MRX6	P48564	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	DSD1	P53095	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	YML037C	Q03703	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	YEH1	Q07804	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	APL4	Q12028	832 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	INP53	Q12271	1107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	SUT2	Q12286	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	CKA1	P15790	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	HOT13	P36078	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	UBP13	P38187	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	NPR2	P39923	615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	ZDS2	P54786	942 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	TIM10	P87108	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	TPO3	Q06451	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	ARG3	P05150	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	RAP1	P11938	827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	RED1	P14291	827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	KAR3	P17119	729 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	MAK32	P23060	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	POL4	P25615	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	RKM3	P38222	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	NNF2	P53253	936 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	NGL3	Q03210	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	TAF11	Q04226	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SDT1	YGL224C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ORC2	P32833	620 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SPO22	P40511	975 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	IRC7	P43623	340 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	TAX4	P47030	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	UBP8	P50102	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	YPR003C	P53394	754 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ATP23	P53722	227 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	PFA5	Q03289	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	OCT1	P35999	772 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	UBP11	P36026	717 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ARN1	P38731	627 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	CIN1	P40987	1014 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	PTR3	P43606	678 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	IRC8	P47046	822 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SWF1	Q04629	336 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	PDR8	Q06149	701 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	MCH4	Q08268	501 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	CIR2	Q08822	631 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	AVL9	Q12500	764 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	YPT6	Q99260	215 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	PET111	P08468	800 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	YCR006C	P25350	157 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SEF1	P34228	1148 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SNO3	P43544	222 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	YFR020W	P43600	232 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	EFM6	P53970	246 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	VPS38	Q05919	439 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	SPE4	Q12455	300 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ICS2	P38284	255 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ELO1	P39540	310 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	ALG5	P40350	334 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	MET28	P40573	187 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	BOP3	P53958	396 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	MAK10	Q02197	733 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	FIN1	Q03898	291 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	CDC45	Q08032	650 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SDT1	YGL224C	RIM20	Q12033	661 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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