RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	SNO2	P53823	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	TPK2	P06245	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	NTH1	P32356	751 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	RRT2	P38332	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	AFG3	P39925	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	UBC11	P52492	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	YAT1	P80235	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	GCN5	Q03330	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	MLH3	Q12083	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	POL1	P13382	1468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	PHO11	P35842	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	AGP2	P38090	596 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	PHO12	P38693	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	YHR218W	P38899	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	NPA3	P47122	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	INP52	P50942	1183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	VID30	P53076	958 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	STU1	P38198	1513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIP20	YGL145W	TRP3	P00937	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DAP2	P18962	818 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	AMD2	P22580	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MSP1	P28737	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SEF1	P34228	1148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YSW1	P38280	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MRX1	P40050	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ATF1	P40353	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	HXT14	P42833	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MSE1	P48525	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SWA2	Q06677	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	COX1	P00401	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	CDC15	P27636	974 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DAD2	P36162	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YPT10	P38146	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	REV7	P38927	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	IRC8	P47046	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YGR111W	P53265	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	NSG2	P53898	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BOP3	P53958	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	IRC13	Q08630	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	UAF30	Q08747	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PCT1	P13259	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	FUB1	P25659	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MSY1	P48527	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YNL092W	P53934	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
TIP20	YGL145W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SIR3	P06701	978 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MRP13	P12686	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	VMA16	P23968	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	LTV1	P34078	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RTT105	P40063	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BUR6	P40096	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	OSW5	P40219	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MAK10	Q02197	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	CDC45	Q08032	650 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	TRM13	Q12383	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	CNE1	P27825	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RML2	P32611	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YEL043W	P32618	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	LNP1	P38878	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ELO3	P40319	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SHE4	P51534	789 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ALT2	P52892	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DIP5	P53388	608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BUD17	P53727	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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