RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W EPL1P43572 832 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W STB2P46679 850 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YJR039WP47107 1121 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SPC105P53148 917 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PEX8P53248 589 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GTR1Q00582 310 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W TIM50Q02776 476 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SRL4Q03085 281 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W USA1Q03714 838 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W NSE5Q03718 556 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W VPS64Q03944 604 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W VIK1Q12045 647 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MED2Q12124 431 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W BBP1Q12365 385 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ZRT2Q12436 422 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W DNA2P38859 1522 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GCN2P15442 1659 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W IQG1Q12280 1495 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CTT1P06115 562 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PMR1P13586 950 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.48□□□□□ -1.85not detected
VFA1YER128W OM45P16547 393 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ALG1P16661 449 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W OSM1P21375 501 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W KRE2P27809 442 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YBL010CP32788 280 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PPQ1P32945 549 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W UBP11P36026 717 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MRX3P38172 270 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MNN1P39106 762 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SSO2P39926 295 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W THO1P40040 218 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W EMP65P40085 556 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W TMA108P40462 946 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SNL1P40548 159 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MAD3P47074 515 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W FMS1P50264 508 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YGL082WP53155 381 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YNL146WP53906 100 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ORC4P54791 529 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ARG5,6Q01217 863 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ATP25Q03153 612 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ARP10Q04549 284 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W STE23Q06010 1027 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W APL4Q12028 832 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W DAS2Q12084 232 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ATG9Q12142 997 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MSH5Q12175 901 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W TIP41Q12199 356 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CMC2Q3E7A4 109 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W LAG2Q92325 660 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SRN2Q99176 213 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YOS9Q99220 542 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ESP1Q03018 1630 aa3.48□□□□□ -1.85
VFA1YER128W STE12P13574 688 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YPK2P18961 677 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W URA4P20051 364 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PRP28P23394 588 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GDA1P32621 518 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ATO2P32907 282 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W KES1P35844 434 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YAP3P38749 330 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SAW1P39735 261 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W UTP25P40498 721 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YIL077CP40508 320 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CIN5P40917 295 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RTS2P40962 232 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W HUL4P40985 892 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data3.47□□□□□ -1.85not detected
VFA1YER128W POL31P46957 487 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W HXT16P47185 567 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W TAF4P50105 388 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MLC1P53141 149 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YDR131CQ03899 556 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RBA50Q04418 439 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W COX20Q04935 205 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RTT103Q05543 409 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GMC2Q06201 188 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W DXO1Q06349 442 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W NDE2Q07500 545 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.3 ms