RNA–Protein interactions for RNA: YDR403W

DIT1, Transcript of Sporulation-specific enzyme required for spore wall maturation, yeast

Gene DIT1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DIT1	YDR403W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ATG9	Q12142	997 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	MNN2	P38069	597 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	RGI2	P40188	164 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	SPO22	P40511	975 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YIH1	P25637	258 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	TOA1	P32773	286 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	NFU1	P32860	256 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	SRO77	P38163	1010 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	PKP1	P40530	394 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
DIT1	YDR403W	SPC19	Q03954	165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YEH1	Q07804	573 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	OSW1	Q08692	278 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	OCA4	P25366	362 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	MSS51	P32335	436 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	REG2	P38232	338 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	UIP3	P39547	235 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YLR287C	Q05881	355 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	TPO3	Q06451	622 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YOL159C	Q08300	171 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	INP53	Q12271	1107 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	SCM3	Q12334	223 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ERP4	Q12450	207 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	CHO1	P08456	276 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	CKA1	P15790	372 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	CCT6	P39079	546 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ORC5	P50874	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	DIA3	P52290	468 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ATP23	P53722	227 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YPT6	Q99260	215 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	AFG3	P39925	761 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	VTC2	P43585	828 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	PFA5	Q03289	374 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YLR455W	Q06188	304 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YLR049C	Q12110	428 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DIT1	YDR403W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	MET17	P06106	444 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	YCR006C	P25350	157 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	ADH7	P25377	361 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	MAK10	Q02197	733 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	BUD7	Q08754	746 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	GPA1	P08539	472 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	RED1	P14291	827 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	ORC2	P32833	620 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	YEL057C	P39983	233 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	HIF1	Q12373	385 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	ERG11	P10614	530 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	RAP1	P11938	827 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	OCT1	P35999	772 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	IRC8	P47046	822 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	NNF2	P53253	936 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	PDR8	Q06149	701 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	MCH4	Q08268	501 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	FRE7	Q12333	620 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	ROX1	P25042	368 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	PXL1	P36166	706 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	ARN1	P38731	627 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.69	□□□□□ -1.5	not detected
DIT1	YDR403W	MAF1	P41910	395 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	SMC3	P47037	1230 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	YGR066C	P53242	292 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	ZDS2	P54786	942 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	IRC3	Q06683	689 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	NPL6	P32832	435 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	YKL050C	P35736	922 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	ELO1	P39540	310 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	MET28	P40573	187 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	YJL107C	P42947	387 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	IRC7	P43623	340 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	EFM6	P53970	246 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DIT1	YDR403W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.3 ms