RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0143	Q0143	PMU1	P36069	295 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	PHO90	P39535	881 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	TMA108	P40462	946 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	ATR1	P13090	542 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	ATP12	P22135	325 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	CLB2	P24869	491 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	MSY1	P48527	492 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YNL193W	P53870	558 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	NTG2	Q08214	380 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	ARP6	Q12509	438 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	TYR1	P20049	452 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	CBF2	P32504	956 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	SEF1	P34228	1148 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	NPR2	P39923	615 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	AXL1	P40851	1208 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YNR071C	P53757	342 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	RRN11	Q04712	507 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	THI4	P32318	326 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YIL060W	P40519	144 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	REE1	P40893	198 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YTP1	P53584	459 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YNL034W	P53963	612 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	SUL2	Q12325	893 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	RAP1	P11938	827 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	SEC62	P21825	274 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	DID4	P36108	232 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	BUD16	P39988	312 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	NUP82	P40368	713 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YIL067C	P40514	678 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	PKP2	P53170	491 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	SKY1	Q03656	742 aa		0.19	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	UBP13	P38187	747 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YPS6	P40583	537 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	MAD2	P40958	196 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	POL31	P46957	487 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	TFB2	Q02939	513 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	ECM11	Q04110	302 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	VPS17	P32913	551 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	ECM15	P35195	104 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	VAM6	Q07468	1049 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	TRE2	Q08693	809 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YPQ1	Q12010	308 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	BAG7	Q12128	409 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	INP53	Q12271	1107 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	IME2	P32581	645 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	VID24	P38263	362 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YHR131C	P38835	850 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	YMR087W	Q04299	284 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0143	Q0143	GAC1	P28006	793 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	SOL4	P53315	255 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	SAM50	P53969	484 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	VHS1	Q03785	461 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	GTB1	Q04924	702 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	RDR1	Q08904	546 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	PET111	P08468	800 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	AIM6	Q07716	390 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	THI20	Q08224	551 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	YCR022C	P25620	114 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	EAF5	P39995	279 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	BSC5	P53755	489 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	PET123	P17558	318 aa		0.12	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	ALG8	P40351	577 aa		0.12	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	DJP1	P40564	432 aa		0.12	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	YSP3	P25036	478 aa		0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	PIM1	P36775	1133 aa		0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	SHO1	P40073	367 aa		0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	CTK2	P46962	323 aa		0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	RPN4	Q03465	531 aa		0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
Q0143	Q0143	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms