RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295488.7

HELQ-201, Transcript of helicase, POLQ like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HELQ, Length 3,579 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQ-201ENST00000295488 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 INTS13Q9NVM9 706 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 TPM3P06753 285 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 MMP10P09238 476 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 CALM1P0DP23 149 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 CALM2P0DP24 149 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 CALM3P0DP25 149 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 ATP2B4P23634 1241 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 DMTNQ08495 405 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.9□□□□□ -0.82
HELQ-201ENST00000295488 KLRF2D3W0D1 207 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 DYNC1I1O14576 645 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 DPYDQ12882 1025 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 BLIDQ8IZY5 108 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PAGE5Q96GU1 130 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.9□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 SMTNL1A8MU46 457 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 G3V3G9 751 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CDC25BP30305 580 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 GSTO1P78417 241 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 TMEM260Q9NX78 707 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 LDHCP07864 332 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 AKR1B1P15121 316 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 NFIAQ12857 509 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PIGSQ96S52 555 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 MTA3Q9BTC8 594 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 SBF2Q86WG5 1849 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 KIF5BP33176 963 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 SLC16A2P36021 539 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 TPM4P67936 248 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CUL4BQ13620 913 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 GJA10Q969M2 543 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 COA7Q96BR5 231 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 MTRQ99707 1265 aa9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CHRNA5P30532 468 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 TEX33O43247 280 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 IL1R1P14778 569 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 RCAN1P53805 252 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 GRM4Q14833 912 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 LETM2Q2VYF4 491 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 BBOX1O75936 387 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ADRA2BP18089 450 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 NAPAP54920 295 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PPP4CP60510 307 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 MORC3Q14149 939 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 DGKHQ86XP1 1220 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 USP40Q9NVE5 1235 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 GDAQ9Y2T3 454 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.88□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 SNAP25P60880 206 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 LRRC15Q8TF66 581 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 SNED1Q8TER0 1413 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 LY75O60449 1722 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 STXBP3O00186 592 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PPP2R5BQ15173 497 aa9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 IKBKBO14920 756 aa9.86□□□□□ -0.83
HELQ-201ENST00000295488 SRGNP10124 158 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms