RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ulk4Q3V129 1303 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EmbP21995 330 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nr5a1P33242 462 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sox5P35710 763 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PRAG1Q571I4 1179 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd40Q5SUE8 363 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Epha10Q8BYG9 1007 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam13bQ8K2H3 851 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lzts2Q91YU6 671 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Thap2Q9D305 217 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmd10Q9Z2X2 231 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scn9aQ62205 1984 aa23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Palm3A2TJV2 734 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DnttP09838 530 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ric8aQ3TIR3 530 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taok2Q6ZQ29 1240 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GypcQ78HU7 95 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arl8aQ8VEH3 186 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UncxO08934 530 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jdp2P97875 163 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jag1Q9QXX0 1218 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uchl5Q9WUP7 329 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TicrrQ8BQ33 1889 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hps4Q99KG7 671 aa23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ambra1A2AH22 1300 aa23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Paxbp1P58501 919 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nsrp1Q5NCR9 542 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces3aQ63880 571 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OplahQ8K010 1288 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nek9Q8K1R7 984 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces3bQ8VCU1 571 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nfil3O08750 462 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eya3P97480 510 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VrtnQ3SYK4 740 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mdh1bQ5F204 500 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RragbQ6NTA4 374 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rasal3Q8C2K5 1041 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk8Q8R3L8 464 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl40Q9D783 621 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema3fO88632 785 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam6bQ6IMH7 756 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aggf1Q7TN31 711 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha7Q91Y13 937 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SelenooQ9DBC0 667 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan18E9PUD6 809 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pak1O88643 545 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp5P56399 858 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdhd1P59328 1117 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EgfrQ01279 1210 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr121Q5CZY0 321 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ovgp1Q62010 721 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd3Q8BFX3 815 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam161bQ8CB59 589 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha12Q91Y18 950 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abhd2Q9QXM0 425 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd209bQ8CJ91 325 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q91WD4 421 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vstm4T1NXB5 319 aa23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nfatc2ipO09130 412 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GpiP06745 558 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gja5Q01231 358 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MyrflQ3UN70 904 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd13aQ80UP5 588 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hs2st1Q8R3H7 356 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ParnQ8VDG3 624 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Txndc5Q91W90 417 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Herc3A6H6S0 1050 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsph10bE9PYQ0 876 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grem2O88273 168 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alppl2P24823 529 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grm4Q68EF4 912 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 WdpcpQ8C456 722 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apol10aQ8CCA5 318 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eps8l1Q8R5F8 716 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arl6ip4Q9JM93 229 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam186bD3Z420 943 aa23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MthfslL7N466 203 aa23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcna1P16388 495 aa23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tacc1Q6Y685 774 aa23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NelfbQ8C4Y3 580 aa23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nr1i2O54915 431 aa23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pola2P33611 600 aa23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Terf1P70371 421 aa23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhpn1Q61085 643 aa23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnga2Q62398 664 aa23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms