Protein–RNA interactions for Protein: Q571I4

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q571I4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43■■■■■ 4,47
PRAG1Q571I4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,93
PRAG1Q571I4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
PRAG1Q571I4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
PRAG1Q571I4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
PRAG1Q571I4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,93■■■■□ 3,66
PRAG1Q571I4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,6■■■■□ 3,61
PRAG1Q571I4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,24■■■■□ 3,55
PRAG1Q571I4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
PRAG1Q571I4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
PRAG1Q571I4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
PRAG1Q571I4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
PRAG1Q571I4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
PRAG1Q571I4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
PRAG1Q571I4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,92■■■■□ 3,34
PRAG1Q571I4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
PRAG1Q571I4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
PRAG1Q571I4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
PRAG1Q571I4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
PRAG1Q571I4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
PRAG1Q571I4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
PRAG1Q571I4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
PRAG1Q571I4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
PRAG1Q571I4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
PRAG1Q571I4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
PRAG1Q571I4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
PRAG1Q571I4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
PRAG1Q571I4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,91■■■■□ 3,18
PRAG1Q571I4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
PRAG1Q571I4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
PRAG1Q571I4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
PRAG1Q571I4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
PRAG1Q571I4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,58■■■■□ 3,13
PRAG1Q571I4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
PRAG1Q571I4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,33■■■■□ 3,09
PRAG1Q571I4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
PRAG1Q571I4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
PRAG1Q571I4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
PRAG1Q571I4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
PRAG1Q571I4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
PRAG1Q571I4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
PRAG1Q571I4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
PRAG1Q571I4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,85■■■■□ 3,01
PRAG1Q571I4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
PRAG1Q571I4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
PRAG1Q571I4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
PRAG1Q571I4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,69■■■□□ 2,98
PRAG1Q571I4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
PRAG1Q571I4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
PRAG1Q571I4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
PRAG1Q571I4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
PRAG1Q571I4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
PRAG1Q571I4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
PRAG1Q571I4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
PRAG1Q571I4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
PRAG1Q571I4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,31■■■□□ 2,92
PRAG1Q571I4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,24■■■□□ 2,91
PRAG1Q571I4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
PRAG1Q571I4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,19■■■□□ 2,9
PRAG1Q571I4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
PRAG1Q571I4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
PRAG1Q571I4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
PRAG1Q571I4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,06■■■□□ 2,88
PRAG1Q571I4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
PRAG1Q571I4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
PRAG1Q571I4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,9■■■□□ 2,86
PRAG1Q571I4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
PRAG1Q571I4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
PRAG1Q571I4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,84■■■□□ 2,85
PRAG1Q571I4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
PRAG1Q571I4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
PRAG1Q571I4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
PRAG1Q571I4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
PRAG1Q571I4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
PRAG1Q571I4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,76■■■□□ 2,84
PRAG1Q571I4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
PRAG1Q571I4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
PRAG1Q571I4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,63■■■□□ 2,81
PRAG1Q571I4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
PRAG1Q571I4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,55■■■□□ 2,8
PRAG1Q571I4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,8
PRAG1Q571I4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
PRAG1Q571I4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
PRAG1Q571I4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
PRAG1Q571I4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
PRAG1Q571I4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
PRAG1Q571I4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,28■■■□□ 2,76
PRAG1Q571I4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
PRAG1Q571I4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
PRAG1Q571I4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,18■■■□□ 2,74
PRAG1Q571I4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,14■■■□□ 2,74
PRAG1Q571I4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,09■■■□□ 2,73
PRAG1Q571I4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
PRAG1Q571I4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
PRAG1Q571I4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
PRAG1Q571I4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
PRAG1Q571I4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
PRAG1Q571I4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
PRAG1Q571I4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
PRAG1Q571I4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms