Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,52■■■■■ 4,88
Palm3A2TJV2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,13■■■■■ 4,33
Palm3A2TJV2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Palm3A2TJV2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,7■■■■□ 3,95
Palm3A2TJV2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,45■■■■□ 3,91
Palm3A2TJV2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,74■■■■□ 3,79
Palm3A2TJV2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Palm3A2TJV2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Palm3A2TJV2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Palm3A2TJV2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Palm3A2TJV2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,07■■■■□ 3,68
Palm3A2TJV2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Palm3A2TJV2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Palm3A2TJV2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Palm3A2TJV2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Palm3A2TJV2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,84■■■■□ 3,49
Palm3A2TJV2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Palm3A2TJV2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,54■■■■□ 3,44
Palm3A2TJV2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,53■■■■□ 3,44
Palm3A2TJV2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Palm3A2TJV2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Palm3A2TJV2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Palm3A2TJV2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
Palm3A2TJV2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Palm3A2TJV2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Palm3A2TJV2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Palm3A2TJV2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Palm3A2TJV2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Palm3A2TJV2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Palm3A2TJV2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Palm3A2TJV2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Palm3A2TJV2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
Palm3A2TJV2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Palm3A2TJV2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Palm3A2TJV2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Palm3A2TJV2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Palm3A2TJV2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Palm3A2TJV2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Palm3A2TJV2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Palm3A2TJV2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Palm3A2TJV2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Palm3A2TJV2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Palm3A2TJV2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Palm3A2TJV2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Palm3A2TJV2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
Palm3A2TJV2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Palm3A2TJV2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Palm3A2TJV2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Palm3A2TJV2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Palm3A2TJV2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Palm3A2TJV2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Palm3A2TJV2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Palm3A2TJV2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Palm3A2TJV2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Palm3A2TJV2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Palm3A2TJV2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Palm3A2TJV2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
Palm3A2TJV2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Palm3A2TJV2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Palm3A2TJV2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Palm3A2TJV2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Palm3A2TJV2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Palm3A2TJV2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Palm3A2TJV2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Palm3A2TJV2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Palm3A2TJV2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Palm3A2TJV2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Palm3A2TJV2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,76■■■□□ 2,99
Palm3A2TJV2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Palm3A2TJV2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Palm3A2TJV2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Palm3A2TJV2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Palm3A2TJV2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,98
Palm3A2TJV2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Palm3A2TJV2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Palm3A2TJV2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Palm3A2TJV2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Palm3A2TJV2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Palm3A2TJV2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Palm3A2TJV2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Palm3A2TJV2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Palm3A2TJV2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Palm3A2TJV2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Palm3A2TJV2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Palm3A2TJV2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Palm3A2TJV2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Palm3A2TJV2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Palm3A2TJV2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Palm3A2TJV2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Palm3A2TJV2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Palm3A2TJV2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Palm3A2TJV2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Palm3A2TJV2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Palm3A2TJV2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Palm3A2TJV2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Palm3A2TJV2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Palm3A2TJV2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Palm3A2TJV2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Palm3A2TJV2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Palm3A2TJV2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms