Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
GypcQ78HU7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GypcQ78HU7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GypcQ78HU7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GypcQ78HU7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GypcQ78HU7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
GypcQ78HU7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GypcQ78HU7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
GypcQ78HU7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
GypcQ78HU7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GypcQ78HU7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GypcQ78HU7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
GypcQ78HU7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GypcQ78HU7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GypcQ78HU7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
GypcQ78HU7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GypcQ78HU7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GypcQ78HU7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
GypcQ78HU7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GypcQ78HU7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GypcQ78HU7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GypcQ78HU7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GypcQ78HU7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GypcQ78HU7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GypcQ78HU7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GypcQ78HU7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GypcQ78HU7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GypcQ78HU7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GypcQ78HU7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
GypcQ78HU7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GypcQ78HU7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GypcQ78HU7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GypcQ78HU7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GypcQ78HU7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GypcQ78HU7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GypcQ78HU7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GypcQ78HU7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GypcQ78HU7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GypcQ78HU7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GypcQ78HU7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
GypcQ78HU7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GypcQ78HU7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GypcQ78HU7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GypcQ78HU7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GypcQ78HU7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GypcQ78HU7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GypcQ78HU7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GypcQ78HU7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GypcQ78HU7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GypcQ78HU7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GypcQ78HU7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GypcQ78HU7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GypcQ78HU7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GypcQ78HU7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GypcQ78HU7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GypcQ78HU7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GypcQ78HU7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GypcQ78HU7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GypcQ78HU7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GypcQ78HU7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GypcQ78HU7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
GypcQ78HU7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GypcQ78HU7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GypcQ78HU7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GypcQ78HU7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GypcQ78HU7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GypcQ78HU7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GypcQ78HU7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GypcQ78HU7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GypcQ78HU7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GypcQ78HU7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GypcQ78HU7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
GypcQ78HU7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GypcQ78HU7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GypcQ78HU7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GypcQ78HU7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GypcQ78HU7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GypcQ78HU7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GypcQ78HU7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GypcQ78HU7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GypcQ78HU7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GypcQ78HU7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GypcQ78HU7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GypcQ78HU7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GypcQ78HU7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GypcQ78HU7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GypcQ78HU7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GypcQ78HU7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GypcQ78HU7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GypcQ78HU7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GypcQ78HU7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GypcQ78HU7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
GypcQ78HU7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GypcQ78HU7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GypcQ78HU7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GypcQ78HU7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 401.8 ms