Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,65■■■■■ 4,42
GypcQ78HU7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
GypcQ78HU7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
GypcQ78HU7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
GypcQ78HU7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
GypcQ78HU7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,43■■■■□ 3,58
GypcQ78HU7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,22■■■■□ 3,55
GypcQ78HU7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,87■■■■□ 3,49
GypcQ78HU7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
GypcQ78HU7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
GypcQ78HU7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
GypcQ78HU7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
GypcQ78HU7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
GypcQ78HU7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
GypcQ78HU7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,67■■■■□ 3,3
GypcQ78HU7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
GypcQ78HU7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
GypcQ78HU7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
GypcQ78HU7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
GypcQ78HU7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
GypcQ78HU7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
GypcQ78HU7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
GypcQ78HU7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,55■■■■□ 3,12
GypcQ78HU7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
GypcQ78HU7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
GypcQ78HU7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
GypcQ78HU7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
GypcQ78HU7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
GypcQ78HU7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
GypcQ78HU7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
GypcQ78HU7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
GypcQ78HU7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
GypcQ78HU7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
GypcQ78HU7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,12■■■■□ 3,05
GypcQ78HU7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
GypcQ78HU7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
GypcQ78HU7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,79■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
GypcQ78HU7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
GypcQ78HU7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
GypcQ78HU7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,62■■■□□ 2,97
GypcQ78HU7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
GypcQ78HU7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
GypcQ78HU7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
GypcQ78HU7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
GypcQ78HU7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
GypcQ78HU7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
GypcQ78HU7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
GypcQ78HU7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
GypcQ78HU7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,01■■■□□ 2,87
GypcQ78HU7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
GypcQ78HU7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
GypcQ78HU7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,92■■■□□ 2,86
GypcQ78HU7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
GypcQ78HU7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,86■■■□□ 2,85
GypcQ78HU7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
GypcQ78HU7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
GypcQ78HU7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,84■■■□□ 2,85
GypcQ78HU7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
GypcQ78HU7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
GypcQ78HU7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,68■■■□□ 2,82
GypcQ78HU7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,65■■■□□ 2,82
GypcQ78HU7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,81
GypcQ78HU7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
GypcQ78HU7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,53■■■□□ 2,8
GypcQ78HU7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
GypcQ78HU7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,46■■■□□ 2,79
GypcQ78HU7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
GypcQ78HU7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
GypcQ78HU7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
GypcQ78HU7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,24■■■□□ 2,75
GypcQ78HU7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
GypcQ78HU7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
GypcQ78HU7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
GypcQ78HU7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
GypcQ78HU7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
GypcQ78HU7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
GypcQ78HU7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
GypcQ78HU7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,09■■■□□ 2,73
GypcQ78HU7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,08■■■□□ 2,73
GypcQ78HU7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
GypcQ78HU7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
GypcQ78HU7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
GypcQ78HU7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,94■■■□□ 2,7
GypcQ78HU7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
GypcQ78HU7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
GypcQ78HU7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
GypcQ78HU7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
GypcQ78HU7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,77■■■□□ 2,68
GypcQ78HU7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
GypcQ78HU7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
GypcQ78HU7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,65■■■□□ 2,66
GypcQ78HU7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
GypcQ78HU7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
GypcQ78HU7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,61■■■□□ 2,65
GypcQ78HU7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
GypcQ78HU7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
GypcQ78HU7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
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