Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,38■■■■■ 5,02
Jag1Q9QXX0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,97■■■■■ 4,47
Jag1Q9QXX0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,24■■■■■ 4,35
Jag1Q9QXX0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,34■■■■■ 4,05
Jag1Q9QXX0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,33■■■■■ 4,05
Jag1Q9QXX0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,55■■■■□ 3,92
Jag1Q9QXX0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Jag1Q9QXX0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Jag1Q9QXX0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Jag1Q9QXX0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Jag1Q9QXX0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Jag1Q9QXX0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,61■■■■□ 3,77
Jag1Q9QXX0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Jag1Q9QXX0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Jag1Q9QXX0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Jag1Q9QXX0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,63■■■■□ 3,61
Jag1Q9QXX0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,4■■■■□ 3,58
Jag1Q9QXX0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Jag1Q9QXX0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Jag1Q9QXX0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Jag1Q9QXX0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Jag1Q9QXX0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Jag1Q9QXX0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Jag1Q9QXX0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Jag1Q9QXX0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Jag1Q9QXX0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Jag1Q9QXX0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,73■■■■□ 3,47
Jag1Q9QXX0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Jag1Q9QXX0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Jag1Q9QXX0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Jag1Q9QXX0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Jag1Q9QXX0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,51■■■■□ 3,44
Jag1Q9QXX0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,42■■■■□ 3,42
Jag1Q9QXX0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Jag1Q9QXX0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Jag1Q9QXX0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Jag1Q9QXX0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Jag1Q9QXX0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Jag1Q9QXX0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Jag1Q9QXX0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Jag1Q9QXX0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Jag1Q9QXX0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Jag1Q9QXX0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Jag1Q9QXX0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Jag1Q9QXX0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Jag1Q9QXX0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Jag1Q9QXX0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Jag1Q9QXX0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Jag1Q9QXX0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Jag1Q9QXX0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Jag1Q9QXX0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,08■■■■□ 3,21
Jag1Q9QXX0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Jag1Q9QXX0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Jag1Q9QXX0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Jag1Q9QXX0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Jag1Q9QXX0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Jag1Q9QXX0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Jag1Q9QXX0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Jag1Q9QXX0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
Jag1Q9QXX0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Jag1Q9QXX0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Jag1Q9QXX0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Jag1Q9QXX0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Jag1Q9QXX0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Jag1Q9QXX0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Jag1Q9QXX0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Jag1Q9QXX0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Jag1Q9QXX0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Jag1Q9QXX0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Jag1Q9QXX0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Jag1Q9QXX0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Jag1Q9QXX0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Jag1Q9QXX0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Jag1Q9QXX0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
Jag1Q9QXX0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Jag1Q9QXX0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Jag1Q9QXX0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Jag1Q9QXX0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Jag1Q9QXX0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Jag1Q9QXX0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Jag1Q9QXX0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Jag1Q9QXX0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Jag1Q9QXX0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Jag1Q9QXX0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Jag1Q9QXX0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Jag1Q9QXX0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Jag1Q9QXX0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Jag1Q9QXX0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Jag1Q9QXX0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Jag1Q9QXX0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Jag1Q9QXX0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Jag1Q9QXX0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Jag1Q9QXX0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Jag1Q9QXX0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Jag1Q9QXX0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Jag1Q9QXX0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
Jag1Q9QXX0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Jag1Q9QXX0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Jag1Q9QXX0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Jag1Q9QXX0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms