Protein–RNA interactions for Protein: P70371

Terf1, Telomeric repeat-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Terf1P70371 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,26■■■■■ 5,16
Terf1P70371 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Terf1P70371 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Terf1P70371 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,07■■■■■ 4,17
Terf1P70371 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,04■■■■■ 4,16
Terf1P70371 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,1■■■■■ 4,01
Terf1P70371 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Terf1P70371 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Terf1P70371 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Terf1P70371 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,43■■■■□ 3,9
Terf1P70371 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Terf1P70371 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Terf1P70371 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Terf1P70371 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,39■■■■□ 3,74
Terf1P70371 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Terf1P70371 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Terf1P70371 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Terf1P70371 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3,67
Terf1P70371 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Terf1P70371 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Terf1P70371 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Terf1P70371 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Terf1P70371 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Terf1P70371 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Terf1P70371 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
Terf1P70371 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Terf1P70371 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Terf1P70371 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Terf1P70371 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,37■■■■□ 3,57
Terf1P70371 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Terf1P70371 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Terf1P70371 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Terf1P70371 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,73■■■■□ 3,47
Terf1P70371 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Terf1P70371 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,59■■■■□ 3,45
Terf1P70371 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Terf1P70371 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Terf1P70371 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Terf1P70371 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Terf1P70371 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Terf1P70371 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Terf1P70371 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Terf1P70371 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,04■■■■□ 3,36
Terf1P70371 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Terf1P70371 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Terf1P70371 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,92■■■■□ 3,34
Terf1P70371 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Terf1P70371 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Terf1P70371 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Terf1P70371 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Terf1P70371 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,44■■■■□ 3,26
Terf1P70371 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,26
Terf1P70371 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Terf1P70371 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,31■■■■□ 3,24
Terf1P70371 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Terf1P70371 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Terf1P70371 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Terf1P70371 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Terf1P70371 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Terf1P70371 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Terf1P70371 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Terf1P70371 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Terf1P70371 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Terf1P70371 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Terf1P70371 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Terf1P70371 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Terf1P70371 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Terf1P70371 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Terf1P70371 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Terf1P70371 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Terf1P70371 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Terf1P70371 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Terf1P70371 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Terf1P70371 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,8■■■■□ 3,16
Terf1P70371 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Terf1P70371 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Terf1P70371 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Terf1P70371 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Terf1P70371 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Terf1P70371 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Terf1P70371 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Terf1P70371 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Terf1P70371 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,51■■■■□ 3,11
Terf1P70371 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Terf1P70371 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Terf1P70371 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Terf1P70371 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Terf1P70371 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Terf1P70371 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Terf1P70371 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Terf1P70371 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Terf1P70371 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Terf1P70371 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Terf1P70371 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Terf1P70371 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Terf1P70371 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Terf1P70371 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Terf1P70371 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Terf1P70371 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Terf1P70371 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,3 ms