Protein–RNA interactions for Protein: P70371

Terf1, Telomeric repeat-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Terf1P70371 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.26■■■■■ 5.16
Terf1P70371 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Terf1P70371 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Terf1P70371 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
Terf1P70371 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Terf1P70371 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Terf1P70371 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Terf1P70371 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Terf1P70371 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Terf1P70371 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Terf1P70371 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Terf1P70371 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Terf1P70371 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Terf1P70371 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Terf1P70371 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Terf1P70371 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Terf1P70371 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Terf1P70371 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Terf1P70371 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Terf1P70371 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Terf1P70371 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Terf1P70371 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Terf1P70371 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Terf1P70371 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Terf1P70371 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Terf1P70371 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Terf1P70371 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Terf1P70371 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Terf1P70371 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Terf1P70371 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Terf1P70371 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Terf1P70371 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Terf1P70371 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Terf1P70371 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Terf1P70371 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Terf1P70371 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Terf1P70371 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Terf1P70371 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Terf1P70371 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Terf1P70371 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Terf1P70371 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Terf1P70371 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Terf1P70371 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Terf1P70371 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Terf1P70371 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Terf1P70371 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Terf1P70371 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Terf1P70371 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Terf1P70371 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Terf1P70371 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Terf1P70371 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Terf1P70371 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Terf1P70371 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Terf1P70371 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Terf1P70371 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Terf1P70371 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Terf1P70371 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Terf1P70371 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Terf1P70371 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Terf1P70371 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Terf1P70371 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Terf1P70371 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Terf1P70371 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Terf1P70371 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Terf1P70371 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Terf1P70371 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Terf1P70371 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Terf1P70371 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Terf1P70371 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Terf1P70371 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Terf1P70371 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Terf1P70371 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Terf1P70371 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Terf1P70371 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Terf1P70371 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Terf1P70371 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Terf1P70371 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Terf1P70371 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Terf1P70371 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Terf1P70371 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Terf1P70371 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Terf1P70371 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Terf1P70371 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Terf1P70371 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Terf1P70371 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Terf1P70371 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Terf1P70371 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Terf1P70371 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Terf1P70371 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Terf1P70371 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Terf1P70371 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Terf1P70371 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Terf1P70371 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Terf1P70371 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Terf1P70371 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Terf1P70371 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Terf1P70371 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Terf1P70371 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Terf1P70371 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Terf1P70371 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms