Protein–RNA interactions for Protein: Q9D305

Thap2, THAP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thap2Q9D305 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Thap2Q9D305 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Thap2Q9D305 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Thap2Q9D305 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Thap2Q9D305 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Thap2Q9D305 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Thap2Q9D305 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Thap2Q9D305 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Thap2Q9D305 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Thap2Q9D305 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Thap2Q9D305 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Thap2Q9D305 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Thap2Q9D305 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Thap2Q9D305 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Thap2Q9D305 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Thap2Q9D305 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Thap2Q9D305 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Thap2Q9D305 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Thap2Q9D305 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Thap2Q9D305 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Thap2Q9D305 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Thap2Q9D305 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Thap2Q9D305 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Thap2Q9D305 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Thap2Q9D305 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Thap2Q9D305 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Thap2Q9D305 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Thap2Q9D305 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Thap2Q9D305 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Thap2Q9D305 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Thap2Q9D305 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Thap2Q9D305 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Thap2Q9D305 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Thap2Q9D305 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Thap2Q9D305 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Thap2Q9D305 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Thap2Q9D305 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Thap2Q9D305 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Thap2Q9D305 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Thap2Q9D305 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Thap2Q9D305 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Thap2Q9D305 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Thap2Q9D305 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Thap2Q9D305 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Thap2Q9D305 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Thap2Q9D305 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Thap2Q9D305 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Thap2Q9D305 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Thap2Q9D305 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Thap2Q9D305 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Thap2Q9D305 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Thap2Q9D305 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Thap2Q9D305 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Thap2Q9D305 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Thap2Q9D305 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Thap2Q9D305 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Thap2Q9D305 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Thap2Q9D305 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Thap2Q9D305 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Thap2Q9D305 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Thap2Q9D305 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Thap2Q9D305 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
Thap2Q9D305 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Thap2Q9D305 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Thap2Q9D305 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Thap2Q9D305 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Thap2Q9D305 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Thap2Q9D305 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Thap2Q9D305 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Thap2Q9D305 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Thap2Q9D305 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Thap2Q9D305 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Thap2Q9D305 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Thap2Q9D305 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Thap2Q9D305 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Thap2Q9D305 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Thap2Q9D305 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Thap2Q9D305 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Thap2Q9D305 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Thap2Q9D305 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Thap2Q9D305 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Thap2Q9D305 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Thap2Q9D305 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Thap2Q9D305 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Thap2Q9D305 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Thap2Q9D305 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Thap2Q9D305 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Thap2Q9D305 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Thap2Q9D305 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Thap2Q9D305 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Thap2Q9D305 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Thap2Q9D305 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Thap2Q9D305 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Thap2Q9D305 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Thap2Q9D305 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Thap2Q9D305 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Thap2Q9D305 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Thap2Q9D305 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Thap2Q9D305 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Thap2Q9D305 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms