RNA–Protein interactions for RNA: YPR172W

YPR172W, Transcript of Putative pyridoxal 5'-phosphate synthase, yeast

Gene YPR172W, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR172W	YPR172W	CRZ1	P53968	678 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	ASI1	P54074	624 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	RSF1	Q05043	376 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	YLR352W	Q06479	807 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	MRX1	P40050	688 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	IAH1	P41734	238 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	YNL234W	P53857	426 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	ARP10	Q04549	284 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	MSS18	P08593	268 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	MGR1	P25573	417 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	NUP120	P35729	1037 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	LHS1	P36016	881 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	GEX2	P36173	615 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	SPC72	P39723	622 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	ERR3	P42222	437 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	ATG27	P46989	271 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	MET14	Q02196	202 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	PFA5	Q03289	374 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	TRS130	Q03660	1102 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YPR172W	YPR172W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	MSH1	P25846	959 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	UBP13	P38187	747 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	EXO84	P38261	753 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	TIP41	Q12199	356 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	CHO1	P08456	276 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PMS1	P14242	873 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	CLB2	P24869	491 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PTP2	P29461	750 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	HIS6	P40545	261 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	CTK2	P46962	323 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	STP3	Q05937	343 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	GAL1	P04385	528 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PET111	P08468	800 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	YML002W	P0CF17	737 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RAP1	P11938	827 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PDR3	P33200	976 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	YBR138C	P38277	524 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	NPR3	P38742	1146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PUG1	P40100	303 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SGF73	P53165	657 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	CRN1	Q06440	651 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	HIM1	Q06674	414 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	BAR1	P12630	587 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	CLB4	P24871	460 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	MRPL36	P36531	177 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	YIR014W	P40570	242 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RTS2	P40962	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	EKI1	Q03764	534 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	ATP4	P05626	244 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	TRS65	P32893	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RIM2	P38127	377 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	ECM10	P39987	644 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	ASE1	P50275	885 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SMA1	Q02651	245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	EDE1	P34216	1381 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RPB8	P20436	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	GID7	P25569	745 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	GAC1	P28006	793 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	TFC3	P34111	1160 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	STV1	P37296	890 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RGI2	P40188	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	MAK10	Q02197	733 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	RSM28	Q03430	361 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	BSC1	Q12140	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	PHO81	P17442	1178 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SRB5	P32585	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SDS24	P38314	527 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	YJR061W	P40355	935 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	HXT9	P40885	567 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	SWP82	P43554	623 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YPR172W	YPR172W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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