RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	RNQ1	P25367	405 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CTS1	P29029	562 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ORC2	P32833	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SRO77	P38163	1010 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YHL017W	P38745	532 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ERC1	P38767	581 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MTG2	P38860	518 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	NPA3	P47122	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YAT1	P80235	687 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YML119W	Q03208	357 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YML037C	Q03703	340 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	GRX6	Q12438	231 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	COX1	P00401	534 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
YVC1	YOR087W	WHI2	P12611	486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	UBP11	P36026	717 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	GLG1	P36143	616 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PCL5	P38794	229 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YEL057C	P39983	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MET18	P40469	1032 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MET28	P40573	187 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MSY1	P48527	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	COG2	P53271	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	COQ6	P53318	479 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
YVC1	YOR087W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PGC1	Q08959	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	LCB4	Q12246	624 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SPE4	Q12455	300 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YIH1	P25637	258 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	BDH2	P39713	417 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	PHM8	P40025	321 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	JJJ1	P53863	590 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SWA2	Q06677	668 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RIM20	Q12033	661 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YSP3	P25036	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	LAC1	P28496	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SMF1	P38925	575 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YJL068C	P40363	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SWP82	P43554	623 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	NNF2	P53253	936 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RMT2	Q03305	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YPT6	Q99260	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	CYB2	P00175	591 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	VMA16	P23968	213 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	GDA1	P32621	518 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	CCT6	P39079	546 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	LCL3	P53153	274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YML053C	Q04978	212 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ISA2	Q12425	185 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	APE1	P14904	514 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	CLB3	P24870	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ADK2	P26364	225 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RXT2	P38255	430 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	VID24	P38263	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	VID30	P53076	958 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AAT1	Q01802	451 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ISN1	Q99312	450 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MRPL9	P31334	269 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AFG3	P39925	761 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MRX1	P40050	688 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	JEM1	P40358	645 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	CTK2	P46962	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SGF73	P53165	657 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	CPR8	P53728	308 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	VPS9	P54787	451 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	PLM2	Q04383	521 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ARG7	Q04728	441 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	BUD7	Q08754	746 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	PMS1	P14242	873 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	CST26	P38226	397 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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