RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	SWP82	P43554	623 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	GND2	P53319	492 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	NGL3	Q03210	505 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	GIS1	Q03833	894 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	TCO89	Q08921	799 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RPS31	YLR167W	RPN13	O13563	156 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ARG3	P05150	338 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	MTH1	P35198	433 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	JHD1	P40034	492 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	MRK1	P50873	501 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	AAT1	Q01802	451 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ARP9	Q05123	467 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YPL272C	Q08984	517 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
RPS31	YLR167W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	STE12	P13574	688 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	MAL33	P38157	468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RGI2	P40188	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	DSD1	P53095	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YNL058C	P53947	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	SFI1	Q12369	946 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	SPE4	Q12455	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	EMP70	P32802	667 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	AGP2	P38090	596 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	UBP13	P38187	747 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	EXO1	P39875	702 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YEL020C	P39994	560 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	MRX1	P40050	688 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ASG1	P40467	964 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	SPO22	P40511	975 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	GLO1	P50107	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RAD34	Q06665	692 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PSR1	Q07800	427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	CBS1	P14066	229 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RED1	P14291	827 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ROX1	P25042	368 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PTC6	P25646	442 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	LHS1	P36016	881 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YGR066C	P53242	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RSM28	Q03430	361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	CYK3	Q07533	885 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YEH1	Q07804	573 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	IRC10	Q08118	586 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ULA1	Q12059	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PNS1	Q12412	539 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	AAD3	P25612	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ERG3	P32353	365 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RPC34	P32910	317 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	CCT6	P39079	546 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	UIP3	P39547	235 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PAC2	P39937	518 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ECM10	P39987	644 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	MET28	P40573	187 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YPL071C	Q02864	156 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
RPS31	YLR167W	POL4	P25615	582 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YIH1	P25637	258 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	GSY2	P27472	705 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PEP3	P27801	918 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YMC1	P32331	307 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	GSH1	P32477	678 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YIL166C	P40445	542 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	PKP1	P40530	394 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YML037C	Q03703	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	YPT6	Q99260	215 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS31	YLR167W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	MET17	P06106	444 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	VMA16	P23968	213 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ADH7	P25377	361 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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