RNA–Protein interactions for RNA: YKR027W

BCH2, Transcript of Member of the ChAPs (Chs5p-Arf1p-binding proteins) family, yeast

Gene BCH2, Length 2,298 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCH2	YKR027W	MSC3	Q05812	728 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	ARR3	Q06598	404 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	SGO1	Q08490	590 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	DCI1	Q08558	271 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	UBX3	Q12229	455 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	GRR1	P24814	1151 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	URK1	P27515	501 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	YUH1	P35127	236 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	SIC1	P38634	284 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	SMC3	P47037	1230 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	EFM3	P47163	339 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	YBP2	P53169	641 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	TWF1	P53250	332 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	LSB1	P53281	241 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	POM34	Q12445	299 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	SEC39	Q12745	709 aa		4.28	□□□□□ -1.72
BCH2	YKR027W	TUP1	P16649	713 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	AFG1	P32317	509 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	DCG1	P32460	244 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	MRE11	P32829	692 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ALG14	P38242	237 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	YIL089W	P40500	205 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	MET12	P46151	657 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	INA17	Q02888	182 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	MCP2	Q06567	569 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RRT8	Q08219	342 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RAS1	P01119	309 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	CLC1	P17891	233 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	VPS33	P20795	691 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	KIN82	P25341	720 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	NTG1	P31378	399 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ATG19	P35193	415 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	NUP60	P39705	539 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ECM1	P39715	212 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	FMS1	P50264	508 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ECM18	Q04623	453 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	AIM41	Q12032	185 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	VPS54	Q12071	889 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	GAL80	P04387	435 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	TPK2	P06245	380 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.26	□□□□□ -1.73	not detected
BCH2	YKR027W	MRPL25	P23369	157 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	STE14	P32584	239 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	EPL1	P43572	832 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RCM1	P53972	490 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	AVL9	Q12500	764 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	APL1	P27351	700 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	SRB5	P32585	307 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	TAT1	P38085	619 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	COS111	P38308	924 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	YBR259W	P38338	688 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	AKR1	P39010	764 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	SER3	P40054	469 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	LRO1	P40345	661 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	SEC9	P40357	651 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	PKP1	P40530	394 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	CTK2	P46962	323 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	PET130	P47065	347 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	KEL2	P50090	882 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	VTA1	Q06263	330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	ECM3	Q99252	613 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	SPE1	P08432	466 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	YIH1	P25637	258 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	RML2	P32611	393 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	YME2	P32843	850 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BCH2	YKR027W	SLM4	P38247	162 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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