RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
CSE4	YKL049C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	TFC3	P34111	1160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	LHS1	P36016	881 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	PXL1	P36166	706 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	MRX1	P40050	688 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	IES5	P40060	125 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	FCP1	Q03254	732 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	ATG16	Q03818	150 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	SNA4	Q07549	140 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	DSE3	Q08729	430 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	SRB5	P32585	307 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	UME6	P39001	836 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	SWP82	P43554	623 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	GTR1	Q00582	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	REG1	Q00816	1014 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	PFA5	Q03289	374 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	CAC2	Q04199	468 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	MLH2	Q07980	695 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	SSM4	P40318	1319 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSE4	YKL049C	PET111	P08468	800 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	STE50	P25344	346 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	CNS1	P33313	385 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	PSY4	P38193	441 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YIL152W	P40455	235 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	CTK2	P46962	323 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SCS3	P53012	380 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	NUP53	Q03790	475 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	TDA9	Q04545	1251 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	POS5	Q06892	414 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	PSR2	Q07949	397 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SRL1	Q08673	210 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	BUD7	Q08754	746 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	VCX1	Q99385	411 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YLR302C	O13544	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	CDC15	P27636	974 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ECM10	P39987	644 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	PCL6	P40038	420 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RIC1	P40395	1056 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	BNA1	P47096	177 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ASI1	P54074	624 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	IZH1	Q03419	316 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RSM28	Q03430	361 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	CHO1	P08456	276 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RAP1	P11938	827 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ERG8	P24521	451 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YCR043C	P25361	127 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	MNN2	P38069	597 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	PSD1	P39006	500 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	VRG4	P40107	337 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YGR021W	P53212	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RTS3	P53289	263 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ECI1	Q05871	280 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	VID22	Q05934	901 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	TRM8	Q12009	286 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YUR1	P26725	428 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	FUI1	P38196	639 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YIL169C	P40442	995 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YFR020W	P43600	232 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	IML2	P47031	731 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	VPS4	P52917	437 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ARP9	Q05123	467 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	NUS1	Q12063	375 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	CBP1	P07252	654 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SLC1	P33333	303 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ESL2	P36168	1195 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	MEP2	P41948	499 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YNR061C	P53747	219 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ESBP6	P53918	673 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	MCP2	Q06567	569 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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